RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	PEX7	P39108	375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	VFA1	P40080	203 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ASG1	P40467	964 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MPS2	P53159	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SLI1	P53304	468 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RCM1	P53972	490 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RAD30	Q04049	632 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ROY1	Q04847	553 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MSH5	Q12175	901 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	NTO1	Q12311	748 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MTR10	Q99189	972 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SPE1	P08432	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ZIP1	P31111	875 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YHR045W	P38775	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YNL195C	P40168	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ELP2	P42935	788 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YJR056C	P47115	236 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	AAD10	P47182	288 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	DCR2	Q05924	578 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PET122	P10355	254 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GEX1	P25596	615 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YCR051W	P25631	222 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ADE1	P27616	306 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	SIP1	P32578	815 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	STE14	P32584	239 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	KKQ8	P36004	724 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GEX2	P36173	615 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YBL029W	P38201	376 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YAP3	P38749	330 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
LEU1	YGL009C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	GLG2	P47011	380 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	YNL143C	P53908	130 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	DIA1	P54005	336 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	FMP30	Q02883	468 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	ATC1	Q04005	294 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	AEP3	Q12089	606 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	INP53	Q12271	1107 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LEU1	YGL009C	PSK1	P31374	1356 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NAM9	P27929	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AIM26	P32858	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YFR018C	P43599	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SLT2	Q00772	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YDC1	Q02896	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	VCX1	Q99385	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YPR089W	O13585	888 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
LEU1	YGL009C	RAD3	P06839	778 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PRE8	P23639	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ERG8	P24521	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	TDP1	P38319	544 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YHR112C	P38716	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
LEU1	YGL009C	SUR2	P38992	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	ACO2	P39533	789 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RGI2	P40188	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	COX16	P47081	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	BRO1	P48582	844 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GOR1	P53839	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	IPI3	P53877	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AQR1	P53943	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	RSM24	Q03976	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	CTS2	Q06350	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GAS5	Q08193	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	GPB1	Q08886	897 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PUS9	Q12069	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AFI1	Q99222	893 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YLR415C	O13578	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	HIS3	P06633	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SNT1	P25357	1226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YCL068C	P25593	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PEP3	P27801	918 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	AFG1	P32317	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	SPO23	P33757	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	YBR139W	P38109	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LEU1	YGL009C	PPS1	P38148	807 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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