RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	COG5	P53951	403 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARP10	Q04549	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	UBX3	Q12229	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RKM5	Q12367	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MET17	P06106	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MSS18	P08593	268 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IME1	P21190	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YCR051W	P25631	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SEC66	P33754	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	TOD6	P34219	525 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SPT10	P35208	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ELO1	P39540	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YEL023C	P39992	682 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LSB6	P42951	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	YFH1	Q07540	174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HMS1	Q12398	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CDC26	P14724	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SAC7	P17121	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MTG2	P38860	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	END3	P39013	349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PEP8	P40335	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YSA1	Q01976	231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RRN11	Q04712	507 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	NCA2	Q12374	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IZH4	Q99393	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DBF20	P32328	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PEX32	P38292	413 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	OSW5	P40219	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IBD2	P53892	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YNL058C	P53947	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	LOT6	Q07923	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GIS3	Q12418	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RTN2	Q12443	393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GCN3	P14741	305 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	OXP1	P28273	1286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ECM25	P32525	599 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	BEM3	P32873	1128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	CIN4	P39110	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	RBG1	P39729	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	IBA57	P47158	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ENA1	P13587	1091 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	VPS33	P20795	691 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DCG1	P32460	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YKL151C	P36059	337 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MRX1	P40050	688 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
DNF2	YDR093W	YGL176C	P46945	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	MDM34	P53083	459 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	PKP2	P53170	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	DID2	P69771	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	YPT6	Q99260	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNF2	YDR093W	SNF4	P12904	322 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TUP1	P16649	713 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YHL044W	P38727	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MKC7	P53379	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	VAC7	P53950	1165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SKO1	Q02100	647 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CDD1	Q06549	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ERG9	P29704	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YKL063C	P35725	167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YBR225W	P38321	900 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MNL1	P38888	796 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LAS21	P40367	830 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TIM10	P87108	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MCP2	Q06567	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SWC7	Q06707	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AVL9	Q12500	764 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms