RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 TNFAIP2Q03169 654 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SNX17Q15036 470 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 IQCA1Q86XH1 822 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 KAT14Q9H8E8 782 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 B4E1Z4 1266 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SMAPO00193 183 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 NFIBO00712 420 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CALML3P27482 149 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF543Q08ER8 600 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SHHQ15465 462 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 USH1GQ495M9 461 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DGKHQ86XP1 1220 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CPVLQ9H3G5 476 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 SMPD1P17405 629 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PTGS1P23219 599 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 GJA9P57773 515 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 FAAP100Q0VG06 881 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 TTC22Q5TAA0 569 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 TLK2Q86UE8 772 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PNMA1Q8ND90 353 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 FAM161BQ96MY7 647 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 KRT23Q9C075 422 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 KATNBL1Q9H079 304 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.97□□□□□ -0.81
LINC00635-217ENST00000608306 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ITGB8P26012 769 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 PDE4DQ08499 809 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 TOX2Q96NM4 488 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ASTN1O14525 1302 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ELP1O95163 1332 aa9.96□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ARVCFO00192 962 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 KIAA0355O15063 1070 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ZEB2O60315 1214 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 SNHG28P0DPA3 235 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 FPGSQ05932 587 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 TRDNQ13061 729 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 IL25Q9H293 177 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 VTA1Q9NP79 307 aa9.95□□□□□ -0.82
LINC00635-217ENST00000608306 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms