RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNP10599 105 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 LNPKQ9C0E8 428 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA6O60684 536 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MICALL1Q8N3F8 863 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 RILPL2Q969X0 211 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PITPNM1O00562 1244 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CA3P07451 260 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCF3P0C7M6 154 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RFC2P35250 354 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM67Q5HYA8 995 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ESR2Q92731 530 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS22Q8NE09 1264 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D5Q92609 795 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN5AQ14524 2016 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RFXAPO00287 272 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTN1P12814 892 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC62Q6P9F0 684 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKHQ86XP1 1220 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RETREG2Q8NC44 543 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 B4DLN1 442 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SDSP20132 328 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP4BP1P59074 171 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A7Q96T83 725 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS4Q9HA82 394 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 COL20A1Q9P218 1284 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF15O94989 841 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA1Q8ND90 353 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 AFG1LQ8WV93 481 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR1Q96RJ0 339 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.41e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-211ENST00000590874 NOD1Q9Y239 953 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 EPOPA6NHQ4 379 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF213O14771 459 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 BFSP2Q13515 415 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6KQ17RY6 165 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE1Q96RT6 745 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB11O95342 1321 aa30.01■■■□□ 2.4
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM4AO75164 1064 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP3P08254 477 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP1Q07960 439 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT14Q6ZU15 432 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MTCH2Q9Y6C9 303 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO9BQ13459 2157 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TFF2Q03403 129 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGISQ16647 500 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC6Q8IVU3 1022 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IL27Q8NEV9 243 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GH1P01241 217 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TAP1Q03518 808 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCA1Q86XH1 822 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKS1AQ92625 1134 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT2BQ92831 832 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT14Q9H8E8 782 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 B4E1Z4 1266 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 COL9A1P20849 921 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST3Q7LGC8 479 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SESTD1Q86VW0 696 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MAF1Q9H063 256 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP1P13497 986 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GPNMBQ14956 572 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT40Q6A162 431 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SMC5Q8IY18 1101 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ARNTL2Q8WYA1 636 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 RMDN3Q96TC7 470 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMA4Q16363 1823 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 BAIAP3O94812 1187 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5C2P49902 561 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 STXBP2Q15833 593 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRED2Q7Z698 418 aa29.96■■■□□ 2.39
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