RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 FYB1O15117 783 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTLC2O15270 562 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TTI1O43156 1089 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GCP02774 474 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GNAT2P19087 354 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SOX11P35716 441 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 MXI1P50539 228 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ARPC4P59998 168 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GABREP78334 506 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT83P78385 493 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TUBA3CQ13748 450 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TNNI3KQ59H18 835 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC39CQ8N584 583 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNN1Q92952 543 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TOMM22Q9NS69 142 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ATRNO75882 1429 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CPDO75976 1380 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PEX5P50542 639 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 HDAC4P56524 1084 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ROR1Q01973 937 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.844e-45■■■■■ 71.2
RABGGTB-214ENST00000497648 INAQ16352 499 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 METTL24Q5JXM2 366 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA1328Q86T90 577 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 USP48Q86UV5 1035 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP57Q86XR8 500 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SMYD1Q8NB12 490 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 RUFY1Q96T51 708 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 LUZP4Q9P127 313 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 STAP2Q9UGK3 403 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 USP21Q9UK80 565 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM64BA6NI03 449 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT10P13645 584 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ARID5AQ03989 594 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC43Q8N309 656 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX11Q96FC9 970 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 HAUS7Q99871 368 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNCQ9H7C4 482 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 BTG4Q9NY30 223 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 C2CD2Q9Y426 696 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 LILRA1O75019 489 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 NEBLO76041 1014 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 S100A6P06703 90 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 CHMLP26374 656 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-214ENST00000497648 WEE1P30291 646 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms