RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 APOBRQ0VD83 1088 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 KCNA10Q16322 511 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 RUFY3Q7L099 469 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 TLK2Q86UE8 772 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 PXMP2Q9NR77 195 aa22.99■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 ACLYP53396 1101 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 NKX3-2P78367 333 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 PPP2R5BQ15173 497 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 GNASQ5JWF2 1037 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 Q9Y3F1 56 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.98■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PQY0 241 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 STXBP2Q15833 593 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 SCFD2Q8WU76 684 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.97■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 CTAGE5O15320 804 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 NR3C2P08235 984 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 PTGS1P23219 599 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 RTP1P59025 263 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 SNX17Q15036 470 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ASGR1P07306 291 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CDC27P30260 824 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 BEX3Q00994 111 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 FUT2Q10981 343 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.95■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 TTLL4Q14679 1199 aa22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CUL5Q93034 780 aa22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 NID2Q14112 1375 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PIK3CDO00329 1044 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ZEB2O60315 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 EVCP57679 992 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM60Q495X7 471 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ELP1O95163 1332 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 MEIS2O14770 477 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 SYN1P17600 705 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ANAPC15P60006 121 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PGM5Q15124 567 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 ARIH2O95376 493 aa22.91■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.91■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.91■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 IL31RAQ8NI17 732 aa22.91■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.91■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CABYRO75952 493 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CCND2P30279 289 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CPT1AP50416 773 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 COPS5Q92905 334 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTPS1-206ENST00000470271 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.89■■□□□ 1.25
CTPS1-206ENST00000470271 NAPAP54920 295 aa22.89■■□□□ 1.25
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