RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RETREG2Q8NC44 543 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 DNERQ8NFT8 737 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 MORC4Q8TE76 937 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 SCFD2Q8WU76 684 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 TAAR1Q96RJ0 339 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 CNNM2Q9H8M5 875 aa10□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 WDR19Q8NEZ3 1342 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.99□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.99□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 RAB30Q15771 203 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 STXBP2Q15833 593 aa9.98□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.98□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 HERVK_113Q902F9 699 aa9.98□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 A6NJR5 290 aa9.96□□□□□ -0.82
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SH3BP1-204ENST00000459646 TTC22Q5TAA0 569 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.96□□□□□ -0.82
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SH3BP1-204ENST00000459646 NR3C2P08235 984 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 EDNRBP24530 442 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 NT5C2P49902 561 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PTH1RQ03431 593 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 BFSP2Q13515 415 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 WTAPQ15007 396 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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