RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 ESR2Q92731 530 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.65■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 PFKMP08237 780 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 CHST3Q7LGC8 479 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 DNERQ8NFT8 737 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 TTC14Q96N46 770 aa22.65■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYM6O95789 1325 aa22.64■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 ZNF213O14771 459 aa22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 CA3P07451 260 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.64■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 VWCEQ96DN2 955 aa22.64■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 ARIH2O95376 493 aa22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 KAT14Q9H8E8 782 aa22.63■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 PNMA1Q8ND90 353 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 MYO9BQ13459 2157 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 A6NJR5 290 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 SDSP20132 328 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 RFC2P35250 354 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 LY6KQ17RY6 165 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 IQCA1Q86XH1 822 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 AFG1LQ8WV93 481 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D5Q92609 795 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 TTC28Q96AY4 2481 aa22.61■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 PTGISQ16647 500 aa22.6■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 SLC9A7Q96T83 725 aa22.6■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 DGKHQ86XP1 1220 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 COL9A1P20849 921 aa22.58■■□□□ 1.21
UBXN4-202ENST00000415164 KCNJ6P48051 423 aa22.58■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.58■■□□□ 1.21
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UBXN4-202ENST00000415164 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 RGS22Q8NE09 1264 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 RMDN3Q96TC7 470 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 COL20A1Q9P218 1284 aa22.57■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 MUC3AQ02505 3323 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 EPOPA6NHQ4 379 aa22.56■■□□□ 1.2
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UBXN4-202ENST00000415164 CFBP00751 764 aa22.56■■□□□ 1.2
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UBXN4-202ENST00000415164 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 KRT40Q6A162 431 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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UBXN4-202ENST00000415164 ALG1Q9BT22 464 aa22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 TLL1O43897 1013 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UBXN4-202ENST00000415164 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.55■■□□□ 1.2
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