RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CD46P15529 392 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC25BP30305 580 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 STAT6P42226 847 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TECP42680 631 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TGFB2P61812 414 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ARID5BQ14865 1188 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC125Q86Z20 511 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA20Q8TB22 786 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM151AQ8WW52 585 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DACH1Q9UI36 760 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM232C9JQI7 657 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFB10O96000 172 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52Z1P0C646 297 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TXKP42681 527 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 STX17P56962 302 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 UBASH3AP57075 661 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DPYDQ12882 1025 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CUL4BQ13620 913 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMC6Q7Z403 805 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF4Q8WV16 495 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CUL5Q93034 780 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MTRQ99707 1265 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PSTPIP2Q9H939 334 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 BCS1LQ9Y276 419 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.5□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FOCADQ5VW36 1801 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRG0 241 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SHTN1A0MZ66 631 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L15C9J2P7 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L11C9JVI0 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L18D6R9N7 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L22D6RA61 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L19D6RCP7 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L20D6RJB6 530 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 LAD1O00515 517 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 OFD1O75665 1012 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 ECE1P42892 770 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L24Q0WX57 530 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN21Q16825 1174 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 TAOK3Q9H2K8 898 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 BMP3P12645 472 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPHP41219 470 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 CABP7Q86V35 215 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 ACER1Q8TDN7 264 aa4.49□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 UIMC1Q96RL1 719 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MED15Q96RN5 788 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 MTFR1LQ9H019 292 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS33BQ9H267 617 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 COL4A5P29400 1685 aa4.49□□□□□ -1.69
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NJR5 290 aa4.48□□□□□ -1.69
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