RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A14Q15043 492 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 JMYQ8N9B5 988 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPA4Q9UI42 421 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM87AQ8NBN3 555 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELP1O95163 1332 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR2O60603 784 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF76P36508 570 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD2Q14681 263 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP19Q99542 508 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL20A1Q9P218 1284 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCER1AP12319 257 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ME1P48163 572 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF16Q5VV41 709 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAAR1Q96RJ0 339 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 RMDN3Q96TC7 470 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT7AO00755 349 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA12O43570 354 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP2K2P36507 400 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPAQ15257 358 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PORCNQ9H237 461 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCC1Q9HA90 598 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEMFO60524 1076 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRHR2Q13324 411 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP4R3AQ6IN85 833 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP31.16■■■□□ 2.581e-10■■■□□ 14.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRA2Q96PE1 1338 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 POTEB2H3BUK9 544 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP6R2O75170 966 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP3A4P08684 503 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 VEGFBP49765 207 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGDRQ13258 359 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOXD1Q6UVY6 613 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCHHQ07283 1943 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCRP11274 1271 aa31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK4P31152 587 aa31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBXN2AP68543 259 aa31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTRA3P83110 453 aa31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 PXMP2Q9NR77 195 aa31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAD1O00515 517 aa31.14■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TDP2O95551 362 aa31.14■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYGNQ8WXF5 182 aa31.14■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMBRD1Q9NUN5 540 aa31.14■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPTORQ8N122 1335 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 STRNO43815 780 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPRNQ4KMQ1 711 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf99Q6UX52 265 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNERQ8NFT8 737 aa31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa31.12■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH6O60337 910 aa31.12■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP3A7P24462 503 aa31.12■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMPD4Q14CM0 1322 aa31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIITAP33076 1130 aa31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2HP62256 183 aa31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCNX4Q63HM2 1172 aa31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa31.11■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4DLN1 442 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 EDIL3O43854 480 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCND2P30279 289 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGM5Q15124 567 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALCRLQ16602 461 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRRA1Q6P2D8 792 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABRAQ8N0Z2 381 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FERMT2Q96AC1 680 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD2LQ9BRP1 358 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHA7Q9UN72 937 aa31.1■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52Z1P0C646 297 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTN2Q02246 1040 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR16Q569H4 304 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR142Q7Z601 462 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 POTEDQ86YR6 584 aa31.09■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC37A4O43826 429 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4orf32Q8N8J7 132 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 IWS1Q96ST2 819 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYH7BA7E2Y1 1941 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CUTAO60888 179 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGK2P07205 417 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR3C2P08235 984 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q4G0T1 1027 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP55Q53EZ4 464 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADALQ6DHV7 355 aa31.08■■■□□ 2.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTHD1Q6ZMT9 781 aa31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms