RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 GAP43P17677 238 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 NNMTP40261 264 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 URGCPQ8TCY9 931 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 RLBP1P12271 317 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 RAPH1Q70E73 1250 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO40Q9UH90 709 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.5□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 YAF2Q8IY57 180 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 MIPOL1Q8TD10 442 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA0232Q92628 1395 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 GBP1P32455 592 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V1E1P36543 226 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 SURF1Q15526 300 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 RAET1EQ8TD07 263 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 TRIM11Q96F44 468 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ATP10DQ9P241 1426 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 TXNDC9O14530 226 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 RNF40O75150 1001 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ASNSP08243 561 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 KRT71Q3SY84 523 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 KCNJ12Q14500 433 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 UBE3CQ15386 1083 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC24Q50LG9 513 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 AFAP1L1Q8TED9 768 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 COA1Q9GZY4 146 aa11.49□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC16A2P36021 539 aa11.48□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 H2AFVQ71UI9 128 aa11.48□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 NLRP4Q96MN2 994 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.48□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.48□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 KCNK3O14649 394 aa11.48□□□□□ -0.57
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TRPS1-201ENST00000220888 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 FBXW4P57775 412 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF653Q96CK0 615 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 SPON1Q9HCB6 807 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 MED23Q9ULK4 1368 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 A6NNZ2 444 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPS1-201ENST00000220888 KRIT1O00522 736 aa11.48□□□□□ -0.57
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