RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SPE3YPR069C URB1P34241 1764 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SPE3YPR069C FKS3Q04952 1785 aa10.02□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C CPS1P27614 576 aa9.99□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C YRF1-3P0CX14 1859 aa9.99□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C YRF1-7P0CX15 1859 aa9.99□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C YRF1-6P53819 1859 aa9.99□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C NAP1P25293 417 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SPE3YPR069C NOP7P53261 605 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C TAF5P38129 798 aa9.94□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C ESL2P36168 1195 aa9.93□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C PRY3P47033 881 aa9.93□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C TAF8Q03750 510 aa9.93□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C RCM1P53972 490 aa9.92□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C EDE1P34216 1381 aa9.9□□□□□ -0.82
SPE3YPR069C YIL177CP40434 1758 aa9.89□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C YJL225CP40889 1758 aa9.89□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C PPH3P32345 308 aa9.89□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C UBP1P25037 809 aa9.88□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C PSK1P31374 1356 aa9.87□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C LEU3P08638 886 aa9.84□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SPE3YPR069C GTT3P39996 337 aa9.83□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C DOT5P40553 215 aa9.83□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C RPN11P43588 306 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C RSF2P46974 1380 aa9.83□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C APC1P53886 1748 aa9.82□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C IES2P40154 320 aa9.82□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C YBL086CP38177 466 aa9.8□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C PRP43P53131 767 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C TCB1Q12466 1186 aa9.78□□□□□ -0.84
SPE3YPR069C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C SNF2P22082 1703 aa9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C SPE2P21182 396 aa9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C UGA2P38067 497 aa9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C NPR2P39923 615 aa9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C SLM3Q12093 417 aa9.76□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C RIM15P43565 1770 aa9.73□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C ALD2P47771 506 aa9.72□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SPE3YPR069C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C YJL181WP46987 611 aa9.71□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C SSA1P10591 642 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C SSA2P10592 639 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C KIP3P53086 805 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C LAM6Q08001 693 aa9.69□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C PRP40P33203 583 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C CSE4P36012 229 aa9.68□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C CTH1P47976 325 aa9.68□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C YKL133CP36066 463 aa9.67□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C YKR075CP36155 307 aa9.66□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SPE3YPR069C COBP00163 385 aa9.64□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C ENP1P38333 483 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C XKS1P42826 600 aa9.64□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C YML133CQ03099 1374 aa9.63□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C YLL067CQ07888 1374 aa9.63□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C YLL066CQ99208 1374 aa9.63□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C YRF1-4O13559 1382 aa9.62□□□□□ -0.87
SPE3YPR069C SPT7P35177 1332 aa9.58□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C SCT1P32784 759 aa9.58□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C SIR4P11978 1358 aa9.58□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C BDF1P35817 686 aa9.57□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C MEC3Q02574 474 aa9.55□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C RCR1P38212 213 aa9.53□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C AAD16Q02895 342 aa9.53□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SPE3YPR069C ADE16P54113 591 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C ALD3P54114 506 aa9.51□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C FKH1P40466 484 aa9.5□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C MSB4Q12317 492 aa9.5□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C PDI1P17967 522 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C RTF1P53064 558 aa9.48□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C GAS4Q08271 471 aa9.48□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SPE3YPR069C AUS1Q08409 1394 aa9.46□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C RAD4P14736 754 aa9.45□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C TAP42Q04372 366 aa9.45□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C GRX4P32642 244 aa9.44□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C TOS1P38288 455 aa9.44□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C ATG13Q06628 738 aa9.44□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C BUG1Q12191 341 aa9.44□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C GRX1P25373 110 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SPE3YPR069C EAF6P47128 113 aa9.41□□□□□ -0.9
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