RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W ISM1P48526 1002 aa4.27□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W LAM6Q08001 693 aa4.27□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W YRR1Q12172 810 aa4.27□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W ENV9Q08651 330 aa4.27□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W RAD54P32863 898 aa4.26□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W CDC4P07834 779 aa4.25□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W SSK2P53599 1579 aa4.25□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W TAF2P23255 1407 aa4.24□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W PEX21P50091 288 aa4.23□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W BNI1P41832 1953 aa4.23□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W NUD1P32336 851 aa4.22□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W YDR444WQ04093 687 aa4.22□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SSQ1YLR369W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W DMA1P38823 416 aa4.2□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W YDL176WQ12027 708 aa4.2□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W MET5P47169 1442 aa4.2□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W GCD11P32481 527 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W CDC25P04821 1589 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W DNF1P32660 1571 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-DR4O74302 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-AP0CX57 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-PR1P0CX58 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-ORP0CX59 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-PR2P0CX60 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-DR5P0CX65 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-ER2P0CX66 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-GR3P0CX67 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-LR1P0CX68 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-MR2P0CX69 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W NPL4P33755 580 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W BDP1P46678 594 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-JR2P47099 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-DR1Q03856 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-BRQ12217 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-NL2Q12470 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TY1A-GR2Q12485 440 aa4.19□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W SEC2P17065 759 aa4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W KIC1P38692 1080 aa4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W SIN3P22579 1536 aa4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W LTE1P07866 1435 aa4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W UFD4P33202 1483 aa4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W HED1Q03937 162 aa4.17□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W TFB4Q12004 338 aa4.17□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W CSC1Q06538 782 aa4.16□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W RRN7P40992 514 aa4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W CKB1P43639 278 aa4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W VPS70P47161 811 aa4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W YDR090CQ03193 310 aa4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
SSQ1YLR369W ITT1Q04638 464 aa4.14□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W CHD1P32657 1468 aa4.14□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W ESP1Q03018 1630 aa4.14□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W ASH1P34233 588 aa4.14□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W RKR1Q04781 1562 aa4.13□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY1B-BRQ12193 1756 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY1B-GR3Q12316 1755 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY1B-ORQ92393 1755 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W MET32Q12041 191 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W RPO31P04051 1460 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W SCC2Q04002 1493 aa4.12□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W IRC20Q06554 1556 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W COX6P00427 148 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-FP0CX63 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-CP25384 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-DR2Q03494 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY1B-DR1Q03855 1755 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-OR1Q12113 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-DR1Q12472 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W TY2B-OR2Q12501 1770 aa4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W AFT1P22149 690 aa4.09□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W MMS1Q06211 1407 aa4.09□□□□□ -1.75
SSQ1YLR369W HST3P53687 447 aa4.09□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W PAN1P32521 1480 aa4.08□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YPK9Q12697 1472 aa4.08□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W PBS2P08018 668 aa4.07□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W ORC6P38826 435 aa4.07□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W DSF2P38213 736 aa4.07□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W SSN2P38931 1420 aa4.07□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YJR115WP47152 169 aa4.06□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-HO13535 1793 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.4 ms