RNA–Protein interactions for RNA: YJL064W

YJL064W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YJL064W, Length 396 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL064WYJL064W UBP1P25037 809 aa12.5□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W LEU3P08638 886 aa12.49□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W CPS1P27614 576 aa12.49□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W YBL086CP38177 466 aa12.48□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W RPN11P43588 306 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
YJL064WYJL064W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W DOT5P40553 215 aa12.43□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W RCM1P53972 490 aa12.43□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W TY4B-HP0C2J7 1802 aa12.42□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W TY4B-JP47024 1803 aa12.42□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W URB1P34241 1764 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W SSA1P10591 642 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
YJL064WYJL064W NAP1P25293 417 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W UGA2P38067 497 aa12.39□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W TAF8Q03750 510 aa12.39□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W PSK1P31374 1356 aa12.38□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W PPH3P32345 308 aa12.37□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W GTT3P39996 337 aa12.37□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W NPR2P39923 615 aa12.36□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W IES2P40154 320 aa12.36□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
YJL064WYJL064W EDE1P34216 1381 aa12.31□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W SSA2P10592 639 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W NOP7P53261 605 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W ALD2P47771 506 aa12.3□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W FKS3Q04952 1785 aa12.3□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W ESL2P36168 1195 aa12.28□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W YJL181WP46987 611 aa12.28□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W TCB1Q12466 1186 aa12.28□□□□□ -0.44
YJL064WYJL064W CTH1P47976 325 aa12.27□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W RSF2P46974 1380 aa12.26□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W YRF1-3P0CX14 1859 aa12.23□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W YRF1-7P0CX15 1859 aa12.23□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W YRF1-6P53819 1859 aa12.23□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W SLM3Q12093 417 aa12.22□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W LAM6Q08001 693 aa12.21□□□□□ -0.45
YJL064WYJL064W PRP40P33203 583 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
YJL064WYJL064W COBP00163 385 aa12.18□□□□□ -0.46
YJL064WYJL064W YKL133CP36066 463 aa12.18□□□□□ -0.46
YJL064WYJL064W YKR075CP36155 307 aa12.16□□□□□ -0.46
YJL064WYJL064W RRD1P40454 393 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W PRP43P53131 767 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W CSE4P36012 229 aa12.12□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W ENP1P38333 483 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W YRF1-4O13559 1382 aa12.11□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W XKS1P42826 600 aa12.11□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W SPE2P21182 396 aa12.1□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
YJL064WYJL064W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
YJL064WYJL064W YIL177CP40434 1758 aa12.07□□□□□ -0.48
YJL064WYJL064W YJL225CP40889 1758 aa12.07□□□□□ -0.48
YJL064WYJL064W APC1P53886 1748 aa12.06□□□□□ -0.48
YJL064WYJL064W KIP3P53086 805 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
YJL064WYJL064W BDF1P35817 686 aa12.02□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W SPT7P35177 1332 aa12.01□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W ALD3P54114 506 aa12□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W SNF2P22082 1703 aa12□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W EAF6P47128 113 aa11.97□□□□□ -0.49
YJL064WYJL064W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W ADE16P54113 591 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W MSB4Q12317 492 aa11.94□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W MEC3Q02574 474 aa11.93□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W RCR1P38212 213 aa11.92□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W YML133CQ03099 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W YLL067CQ07888 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W YLL066CQ99208 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
YJL064WYJL064W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W DPS1P04802 557 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W TOS1P38288 455 aa11.88□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W SAP155P43612 1002 aa11.88□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W BUG1Q12191 341 aa11.88□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W SIR4P11978 1358 aa11.88□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W GAS4Q08271 471 aa11.87□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W RIM15P43565 1770 aa11.85□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W MSN5P52918 1224 aa11.84□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
YJL064WYJL064W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W ATG13Q06628 738 aa11.83□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W RAD4P14736 754 aa11.82□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W CTT1P06115 562 aa11.81□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W SSA4P22202 642 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W HPC2Q01448 625 aa11.8□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W SQS1P53866 767 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W KIN4Q01919 800 aa11.79□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W MHP1P43638 1398 aa11.79□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W YER156CP40093 338 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
YJL064WYJL064W OSM1P21375 501 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
YJL064WYJL064W GRX1P25373 110 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.7 ms