RNA–Protein interactions for RNA: YHR204W

MNL1, Transcript of Alpha-1,2-specific exomannosidase of the endoplasmic reticulum, yeast

Gene MNL1, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL1	YHR204W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MNL1	YHR204W	WSC3	Q12215	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MNL1	YHR204W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	BUD4	P47136	1447 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	CDC73	Q06697	393 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	PSH1	Q12161	406 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	PDR10	P51533	1564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	QCR6	P00127	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	PAF1	P38351	445 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	ROX1	P25042	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	PTC4	P38089	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	VNX1	P42839	908 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	YPP1	P46951	817 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SRB8	P25648	1427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SCJ1	P25303	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	BIM1	P40013	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	ATG32	P40458	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	FPK1	P53739	893 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	IOC2	Q12072	812 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	BRL1	P38770	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	MID1	P41821	548 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	CSC1	Q06538	782 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SIT4	P20604	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	YJL007C	P47080	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	HST2	P53686	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MNL1	YHR204W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	PEP1	P32319	1579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	ESS1	P22696	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YJU3	P28321	313 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	CLB5	P30283	435 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	SPC110	P32380	944 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	ERG12	P07277	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	JIP4	Q03361	876 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	BIO2	P32451	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	ULI1	P43604	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	MPC54	Q08550	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	TFB4	Q12004	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	RSC30	P38781	883 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	PML39	Q03760	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	MMP1	Q12372	583 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	BPT1	P14772	1559 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	TAF2	P23255	1407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	RAD59	Q12223	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	PCT1	P13259	424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	MSH3	P25336	1018 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	DOS2	P54858	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	GRX3	Q03835	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	DPL1	Q05567	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	SIC1	P38634	284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YTA7	P40340	1379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	SPP1	Q03012	353 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	ERF2	Q06551	359 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	YRR1	Q12172	810 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MNL1	YHR204W	STU1	P38198	1513 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YIR014W	P40570	242 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YBL036C	P38197	257 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	NMA111	P53920	997 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	PEX29	Q03370	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	NUP170	P38181	1502 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	MSP1	P28737	362 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	SMC3	P47037	1230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YNL108C	P53929	270 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	YNL011C	P53980	444 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	DSN1	P40568	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	LDB19	Q12502	818 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MNL1	YHR204W	PEX21	P50091	288 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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