RNA–Protein interactions for RNA: YHR116W

COX23, Transcript of Protein that functions in mitochondrial copper homeostasis, yeast

Gene COX23, Length 456 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX23	YHR116W	PDR10	P51533	1564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX23	YHR116W	VPS29	P38759	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	RTG3	P38165	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	FKH1	P40466	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	ULI1	P43604	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	LDB19	Q12502	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	CAT8	P39113	1433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	IFH1	P39520	1085 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	DMA2	P53924	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	BMT6	Q12291	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX23	YHR116W	STS1	P38637	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	MSB4	Q12317	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	YBT1	P32386	1661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	RAM2	P29703	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
COX23	YHR116W	IOC2	Q12072	812 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	YAP3	P38749	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	CKB1	P43639	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	BNR1	P40450	1375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX23	YHR116W	RTG1	P32607	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	SET4	P42948	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	SRB8	P25648	1427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	MAK10	Q02197	733 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	SEC61	P32915	480 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COX23	YHR116W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	EDS1	P38073	919 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	IPL1	P38991	367 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	VPS70	P47161	811 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	COQ8	P27697	501 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	USO1	P25386	1790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	SAM3	Q08986	587 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	JIP4	Q03361	876 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	RLF2	Q12495	606 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
COX23	YHR116W	DCW1	P36091	449 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	GYP5	Q12344	894 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	IML1	P47170	1584 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	SAP30	P38429	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	VMR1	P38735	1592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	HTA2	P04912	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	THI12	P42883	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	THI5	P43534	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	THI11	P47183	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	THI13	Q07748	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	BCK2	P33306	851 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	DSF2	P38213	736 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	ATH1	P48016	1211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	GCN2	P15442	1659 aa		4.65	□□□□□ -1.66
COX23	YHR116W	KIN1	P13185	1064 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	PTC4	P38089	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	DAN4	P47179	1161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	YEL023C	P39992	682 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	SSM4	P40318	1319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	PBS2	P08018	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	PRE3	P38624	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	SOL3	P38858	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	GUT1	P32190	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	MRX12	P47084	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	PDR11	P40550	1411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	DIT2	P21595	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	PAF1	P38351	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	GLC3	P32775	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX23	YHR116W	RAV1	P47104	1357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COX23	YHR116W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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