RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A SEC2P17065 759 aa8.19□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-DR4O74302 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-AP0CX57 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-ORP0CX59 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-JR2P47099 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-DR1Q03856 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-BRQ12217 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-NL2Q12470 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-GR2Q12485 440 aa8.18□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A YPR109WQ06104 294 aa8.16□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A RRN7P40992 514 aa8.15□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YHL009W-AYHL009W-A RGR1P19263 1082 aa8.13□□□□□ -1.11
YHL009W-AYHL009W-A BDP1P46678 594 aa8.1□□□□□ -1.11
YHL009W-AYHL009W-A HED1Q03937 162 aa8.09□□□□□ -1.11
YHL009W-AYHL009W-A YDR444WQ04093 687 aa8.09□□□□□ -1.11
YHL009W-AYHL009W-A YDL176WQ12027 708 aa8.08□□□□□ -1.12
YHL009W-AYHL009W-A KEX2P13134 814 aa8.05□□□□□ -1.12
YHL009W-AYHL009W-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YHL009W-AYHL009W-A ERF2Q06551 359 aa8.04□□□□□ -1.12
YHL009W-AYHL009W-A PBS2P08018 668 aa7.98□□□□□ -1.13
YHL009W-AYHL009W-A CKB1P43639 278 aa7.97□□□□□ -1.13
YHL009W-AYHL009W-A AFT1P22149 690 aa7.96□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A MET32Q12041 191 aa7.96□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A ASH1P34233 588 aa7.95□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A MOD5P07884 428 aa7.92□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A CLB5P30283 435 aa7.92□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A TUB4P53378 473 aa7.92□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A PUS5Q06244 254 aa7.91□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A HST3P53687 447 aa7.9□□□□□ -1.14
YHL009W-AYHL009W-A AGE1Q04412 482 aa7.89□□□□□ -1.15
YHL009W-AYHL009W-A MAM3Q12296 706 aa7.88□□□□□ -1.15
YHL009W-AYHL009W-A YNL115CP53925 644 aa7.87□□□□□ -1.15
YHL009W-AYHL009W-A RTF1P53064 558 aa7.86□□□□□ -1.15
YHL009W-AYHL009W-A MTC5Q03897 1148 aa7.86□□□□□ -1.15
YHL009W-AYHL009W-A YJR115WP47152 169 aa7.82□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A TEA1P47988 759 aa7.82□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A IES2P40154 320 aa7.8□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A KXD1P53158 218 aa7.8□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A SIT4P20604 311 aa7.79□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A DSF2P38213 736 aa7.78□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A ACO2P39533 789 aa7.78□□□□□ -1.16
YHL009W-AYHL009W-A NIS1P53939 407 aa7.76□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A HXT10P43581 546 aa7.75□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A CAF120P53836 1060 aa7.74□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A TPD3P31383 635 aa7.73□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A SLY41P22215 453 aa7.72□□□□□ -1.17
YHL009W-AYHL009W-A PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A DIT2P21595 489 aa7.69□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A TRK2P28584 889 aa7.69□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A YMR196WQ04336 1088 aa7.69□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A UGA3P26370 528 aa7.68□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A FPK1P53739 893 aa7.68□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A KIP2P28743 706 aa7.67□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A OPT2Q06593 877 aa7.66□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A ALR1Q08269 859 aa7.66□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A PUS6P53294 404 aa7.65□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A TBF1Q02457 562 aa7.65□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A SRF1Q12516 437 aa7.65□□□□□ -1.18
YHL009W-AYHL009W-A YGR035CP53222 116 aa7.64□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A RPA14P50106 137 aa7.63□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A YDL206WQ12424 762 aa7.63□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A IXR1P33417 597 aa7.62□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A YLR346CQ06139 101 aa7.62□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A YPR097WQ06839 1073 aa7.61□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A SCJ1P25303 377 aa7.6□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A DMA1P38823 416 aa7.59□□□□□ -1.19
YHL009W-AYHL009W-A YIR007WP40566 764 aa7.58□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A HPF1Q05164 967 aa7.58□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.56□□□□□ -1.2not detected
YHL009W-AYHL009W-A TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A HST2P53686 357 aa7.55□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A NUP85P46673 744 aa7.54□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A MMP1Q12372 583 aa7.54□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-BLQ12266 440 aa7.53□□□□□ -1.2
YHL009W-AYHL009W-A RTT106P40161 455 aa7.52□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A SCW11P53189 542 aa7.52□□□□□ -1.21
YHL009W-AYHL009W-A ATF2P53296 535 aa7.51□□□□□ -1.21
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