RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W CDC73Q06697 393 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W YRR1Q12172 810 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-HO13535 1793 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-JR1P47098 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-ER1Q03612 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-GR2Q12269 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-OLQ12273 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-BRQ12193 1756 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-GR3Q12316 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W TY1B-ORQ92393 1755 aa2.84□□□□□ -1.95
MDS3YGL197W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W BRE2P43132 505 aa2.83□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W KXD1P53158 218 aa2.83□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W MVP1P40959 511 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
MDS3YGL197W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W YLR346CQ06139 101 aa2.82□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W YNL115CP53925 644 aa2.82□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W TEA1P47988 759 aa2.81□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W YPR109WQ06104 294 aa2.81□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W RGR1P19263 1082 aa2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W HST3P53687 447 aa2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W AIM7Q12156 149 aa2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W SIT4P20604 311 aa2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data2.8□□□□□ -1.96not detected
MDS3YGL197W GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W HGH1P48362 394 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W NUP170P38181 1502 aa2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W AFT1P22149 690 aa2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W ENV9Q08651 330 aa2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W LAM6Q08001 693 aa2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W RGA1P39083 1007 aa2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W ALR1Q08269 859 aa2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W SIN3P22579 1536 aa2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W RPA14P50106 137 aa2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W TBF1Q02457 562 aa2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W YMR196WQ04336 1088 aa2.78□□□□□ -1.96
MDS3YGL197W PUS6P53294 404 aa2.78□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W YPR015CQ12531 247 aa2.78□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W STR2P47164 639 aa2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W SSA2P10592 639 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W PDR1P12383 1068 aa2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W ISM1P48526 1002 aa2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W HST2P53686 357 aa2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W SRC1Q03707 834 aa2.77□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W IES2P40154 320 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W YPL062WQ02781 134 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W MRX12P47084 519 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-ER2Q03619 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-MR1Q04214 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-NL1Q12112 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-GR1Q12141 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W TY1B-BLQ12490 1755 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W ATF2P53296 535 aa2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W ATG3P40344 310 aa2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W RRD1P40454 393 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W RRN7P40992 514 aa2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W YPR204WQ08995 1032 aa2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W YPR097WQ06839 1073 aa2.75□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W LEU3P08638 886 aa2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W MRT4P33201 236 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W ARG82P07250 355 aa2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W GLN1P32288 370 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W GLY1P37303 387 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W RAS1P01119 309 aa2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W HXT10P43581 546 aa2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W NAF1P53919 492 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W YDR344CQ05510 147 aa2.74□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W MOD5P07884 428 aa2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W NUP85P46673 744 aa2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W NUP42P49686 430 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W SRF1Q12516 437 aa2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W CSE4P36012 229 aa2.73□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W BDP1P46678 594 aa2.72□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W DMA1P38823 416 aa2.72□□□□□ -1.97
MDS3YGL197W DPH6Q12429 685 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms