RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.39■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 GBP4Q96PP9 640 aa20.38■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.38■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.38■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 KCNH8Q96L42 1107 aa20.38■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 GPATCH3Q96I76 525 aa20.37■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.36■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 SOX12O15370 315 aa20.36■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.35■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.34■□□□□ 0.85
NFIC-211ENST00000641145 TPM2P07951 284 aa20.33■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.32■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 126.6
NFIC-211ENST00000641145 ABCC9O60706 1549 aa20.3■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 APBB1O00213 710 aa20.3■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NFIC-211ENST00000641145 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 GPS2Q13227 327 aa20.26■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 PHF14O94880 888 aa20.25■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 TPM1P09493 284 aa20.24■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.24■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.24■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.23■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.21■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NFIC-211ENST00000641145 TOMM22Q9NS69 142 aa20.2■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.19■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.19■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 KIF3AQ9Y496 699 aa20.18■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 HMMRO75330 724 aa20.17■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.16■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 ODF2Q5BJF6 829 aa20.15■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
NFIC-211ENST00000641145 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.13■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.13■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 KIF16BQ96L93 1317 aa20.12■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 MIER1Q8N108 512 aa20.12■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 RAD21O60216 631 aa20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 H3BQV1 296 aa20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 IFFO2Q5TF58 517 aa20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.1■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.09■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NFIC-211ENST00000641145 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 CDR1P51861 262 aa20.07■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 PAF1Q8N7H5 531 aa20.07■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 MAP7D2Q96T17 732 aa20.07■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 RUFY1Q96T51 708 aa20.06■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 MORC1Q86VD1 984 aa20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 TEX35Q5T0J7 233 aa20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 KANK1Q14678 1352 aa20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.05■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 STK31Q9BXU1 1019 aa20.04■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.04■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 AK7Q96M32 723 aa20.03■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.02■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 TMF1P82094 1093 aa20.02■□□□□ 0.8
NFIC-211ENST00000641145 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.01■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 CCDC191Q8NCU4 936 aa20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 CHMP4CQ96CF2 233 aa20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 MSH5O43196 834 aa20■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 MLECQ14165 292 aa19.99■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 BECN2A8MW95 431 aa19.99■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.98■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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