RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-208ENST00000589162 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 PRXQ9BXM0 1461 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 CHD1O14646 1710 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 CUL7Q14999 1698 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF21BO75037 1637 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 POTEFA5A3E0 1075 aa9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA3Q08378 1498 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNJ2O15056 1496 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-208ENST00000589162 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN2AQ12879 1464 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K13O43283 966 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP170Q5SW79 1584 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SNPHO15079 494 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 ST18O60284 1047 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-208ENST00000589162 MMRN1Q13201 1228 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP160Q12769 1436 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 PROM2Q8N271 834 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 P3H3Q8IVL6 736 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPC6Q9Y210 931 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 IQGAP2Q13576 1575 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCG2P16885 1265 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 MIER1Q8N108 512 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP162Q5TB80 1403 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.71□□□□□ -0.85
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 CLIP1P30622 1438 aa9.69□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.68□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 RASEFQ8IZ41 740 aa9.68□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.67□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 JPH4Q96JJ6 628 aa9.67□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 ARAP1Q96P48 1450 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 SHROOM2Q13796 1616 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMD9Q5K651 1589 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 DISP1Q96F81 1524 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0556O60303 1618 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-208ENST00000589162 OCEL1Q9H607 264 aa9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.61□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID3CA6NKF2 412 aa9.6□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CAPNS1-208ENST00000589162 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF11O15085 1522 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNL1Q8IU54 200 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM212AQ96EL1 285 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRGP23470 1445 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA8O94911 1581 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 FMN1Q68DA7 1419 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 NUBP1P53384 320 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 EMP3P54852 163 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 MARVELD3Q96A59 401 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 HECW1Q76N89 1606 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 UACAQ9BZF9 1416 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.46□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC2Q92887 1545 aa9.46□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.46□□□□□ -0.89
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP10BO94823 1461 aa9.46□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 TIAM1Q13009 1591 aa9.46□□□□□ -0.9
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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