RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 PLCH2O75038 1416 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 ATP10AO60312 1499 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.31■□□□□ 0.04
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PTPRM-210ENST00000578916 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.3■□□□□ 0.04
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PTPRM-210ENST00000578916 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
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PTPRM-210ENST00000578916 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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PTPRM-210ENST00000578916 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRM-210ENST00000578916 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRM-210ENST00000578916 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRM-210ENST00000578916 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 CPS1P31327 1500 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 TNRQ92752 1358 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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