RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-211ENST00000471643 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-211ENST00000471643 STRCQ7RTU9 1775 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-211ENST00000471643 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-211ENST00000471643 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-211ENST00000471643 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP10AO60312 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 PLCH2O75038 1416 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.71■■□□□ 1.55
RALGPS1-211ENST00000471643 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.68■■□□□ 1.54
RALGPS1-211ENST00000471643 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPRTO14522 1441 aa24.65■■□□□ 1.54
RALGPS1-211ENST00000471643 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.64■■□□□ 1.53
RALGPS1-211ENST00000471643 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-211ENST00000471643 AFAP1Q8N556 730 aa24.58■■□□□ 1.53
RALGPS1-211ENST00000471643 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 KDM5CP41229 1560 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 C3P01024 1663 aa24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 REREQ9P2R6 1566 aa24.52■■□□□ 1.52
RALGPS1-211ENST00000471643 KIF14Q15058 1648 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 NCOA1Q15788 1441 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCA6Q8N139 1617 aa24.47■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 EEA1Q15075 1411 aa24.45■■□□□ 1.51
RALGPS1-211ENST00000471643 AGLP35573 1532 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.45■■□□□ 1.5
RALGPS1-211ENST00000471643 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.42■■□□□ 1.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
RALGPS1-211ENST00000471643 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
RALGPS1-211ENST00000471643 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.38■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 FMN1Q68DA7 1419 aa24.36■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.35■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 NPATQ14207 1427 aa24.33■■□□□ 1.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCC1P33527 1531 aa24.32■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.31■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CLIP1P30622 1438 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ZMYM3Q14202 1370 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 PREX2Q70Z35 1606 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-211ENST00000471643 MROH2AA6NES4 1674 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-211ENST00000471643 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PLA2R1Q13018 1463 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-211ENST00000471643 PKD2Q13563 968 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-211ENST00000471643 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 HSPA1LP34931 641 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPRKQ15262 1439 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-211ENST00000471643 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 PLXNC1O60486 1568 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 PIP4K2BP78356 416 aa24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RALGPS1-211ENST00000471643 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.07■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP7AQ04656 1500 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 A2MP01023 1474 aa24.06■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 GGT6Q6P531 493 aa24.05■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.03■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 TOM1O60784 492 aa24.03■■□□□ 1.44
RALGPS1-211ENST00000471643 CPS1P31327 1500 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-211ENST00000471643 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-211ENST00000471643 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.01■■□□□ 1.43
RALGPS1-211ENST00000471643 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-211ENST00000471643 ALKQ9UM73 1620 aa24■■□□□ 1.43
RALGPS1-211ENST00000471643 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.94■■□□□ 1.42
RALGPS1-211ENST00000471643 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
RALGPS1-211ENST00000471643 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
RALGPS1-211ENST00000471643 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
RALGPS1-211ENST00000471643 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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