RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-209ENST00000446688 FOXD1Q16676 465 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-209ENST00000446688 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 TMF1P82094 1093 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 KANK1Q14678 1352 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.93□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 SOX12O15370 315 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 KIF21BO75037 1637 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 NESP48681 1621 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-209ENST00000446688 STK26Q9P289 416 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 FMN1Q68DA7 1419 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 NUP155O75694 1391 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 JPH4Q96JJ6 628 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.86□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 KIF3BO15066 747 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.85□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 MORC1Q86VD1 984 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 MSH5O43196 834 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 RGS3P49796 1198 aa12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
TNS1-209ENST00000446688 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.82□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 MS4A1P11836 297 aa12.81□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 PDE3BQ13370 1112 aa12.8□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 PDE4AP27815 886 aa12.8□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 GSE1Q14687 1217 aa12.8□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.8□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 TOPBP1Q92547 1522 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 RALBP1Q15311 655 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 IGF1RP08069 1367 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-209ENST00000446688 IFT140Q96RY7 1462 aa12.77□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 TOP2BQ02880 1626 aa12.76□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 SYNJ1O43426 1573 aa12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 GRIN2BQ13224 1484 aa12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.75□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 CASC1Q6TDU7 716 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 NPHP1O15259 732 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 CUX1P39880 1505 aa12.73□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 40.1
TNS1-209ENST00000446688 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 UACAQ9BZF9 1416 aa12.72□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TNS1-209ENST00000446688 OSCARQ8IYS5 282 aa12.71□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 CCDC7Q96M83 1385 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 ARAP1Q96P48 1450 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.7□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 WDR97A6NE52 1622 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 NLRP13Q86W25 1043 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.69□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 KIF15Q9NS87 1388 aa12.67□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 PTPRGP23470 1445 aa12.67□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 KCNJ4P48050 445 aa12.67□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2FA1L443 756 aa12.67□□□□□ -0.38
TNS1-209ENST00000446688 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms