RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423499.3

BX005214.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BX005214.2, Length 1,077 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BX005214.2-201ENST00000423499 SOX12O15370 315 aa16.1■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 GOLGA2Q08379 1002 aa16.08■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.08■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 PRDM2Q13029 1718 aa16.07■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.06■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.06■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEIP0CG38 1075 aa16.04■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 NLRP6P59044 892 aa16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR62O43379 1518 aa16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.01■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.98■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCC8Q09428 1581 aa15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 TOPBP1Q92547 1522 aa15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 PPP1R37O75864 691 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 IER5LQ5T953 404 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.89■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 CUX1P39880 1505 aa15.85■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.85■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 IFT140Q96RY7 1462 aa15.83■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 SLC39A7Q92504 469 aa15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 OCEL1Q9H607 264 aa15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.8■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.79■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 SOGA1O94964 1423 aa15.78■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.78■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 C7P10643 843 aa15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 PLCG2P16885 1265 aa15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.77■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 METRNQ9UJH8 293 aa15.76■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEFA5A3E0 1075 aa15.74■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 SYNJ1O43426 1573 aa15.73■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 SEC24BO95487 1268 aa15.72■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 TOP2BQ02880 1626 aa15.72■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 LHX8Q68G74 356 aa15.7■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 MICALL2Q8IY33 904 aa15.67■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.61■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR97A6NE52 1622 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 GRIN2BQ13224 1484 aa15.57■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 G3V3G9 751 aa15.56■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEB2H3BUK9 544 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 PDE4AP27815 886 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 MFSD10Q14728 455 aa15.51■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR70Q9NW82 654 aa15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 KIF27Q86VH2 1401 aa15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 PBRM1Q86U86 1689 aa15.47■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 SYNJ2O15056 1496 aa15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 KIF3CO14782 793 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 TMC2Q8TDI7 906 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.42■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 IGF1RP08069 1367 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 C2orf72A6NCS6 295 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEJP0CG39 1038 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 ADAMTS12P58397 1594 aa15.4■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 CHD1O14646 1710 aa15.4■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.39■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.39■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 DSG2Q14126 1118 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 E2F4Q16254 413 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 P3H3Q8IVL6 736 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 OTUD5Q96G74 571 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms