RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421843.5

PCBP1-AS1-218, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 664 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.49□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.49□□□□□ -0.41
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.44□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PRDM2Q13029 1718 aa12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CFTRP13569 1480 aa12.41□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 G3V3G9 751 aa12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CABP2Q9NPB3 220 aa12.4□□□□□ -0.42
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.38□□□□□ -0.43
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.37□□□□□ -0.43
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.33□□□□□ -0.44
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ERBB3P21860 1342 aa12.28□□□□□ -0.44
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 DOK7Q18PE1 504 aa12.27□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 SPOCK2Q92563 424 aa12.27□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 NESP48681 1621 aa12.26□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.23□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RIMBP2O15034 1052 aa12.21□□□□□ -0.45
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.2□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.2□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.19□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.15□□□□□ -0.46
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.15□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ABCC8Q09428 1581 aa12.13□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.13□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.12□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 MICALL2Q8IY33 904 aa12.12□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TOP2BQ02880 1626 aa12.11□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.11□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 WDR62O43379 1518 aa12.11□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.1□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CUX1P39880 1505 aa12.1□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.09□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.09□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 SYNJ1O43426 1573 aa12.08□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TOPBP1Q92547 1522 aa12.07□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TRIM41Q8WV44 630 aa12.07□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 GPR153Q6NV75 609 aa12.06□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ERCC6Q03468 1493 aa12.04□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 SOX12O15370 315 aa12.02□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 MS4A4AQ96JQ5 239 aa12.01□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PTGER2P43116 358 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ARSIQ5FYB1 569 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 WDR97A6NE52 1622 aa11.99□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CUX2O14529 1486 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.97□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.95□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 IFT140Q96RY7 1462 aa11.92□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.89□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 SOGA1O94964 1423 aa11.88□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.86□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 EEA1Q15075 1411 aa11.86□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 NLRP6P59044 892 aa11.85□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KIF27Q86VH2 1401 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 NUDT7P0C024 238 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PBRM1Q86U86 1689 aa11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PBX2P40425 430 aa11.79□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.78□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.77□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.77□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 CUL7Q14999 1698 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 C2orf72A6NCS6 295 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 KIF3CO14782 793 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 LHX6Q9UPM6 363 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 IGF1RP08069 1367 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 GRIN2BQ13224 1484 aa11.76□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PRXQ9BXM0 1461 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 STK24Q9Y6E0 443 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-218ENST00000421843 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms