RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 HMGXB3Q12766 1538 aa22.28■■□□□ 1.16
PKP4-204ENST00000421462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PKP4-204ENST00000421462 KDM6BO15054 1643 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP4-204ENST00000421462 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP4-204ENST00000421462 PDE4AP27815 886 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP4-204ENST00000421462 SLC4A3P48751 1232 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP4-204ENST00000421462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP4-204ENST00000421462 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 PLIN1O60240 522 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PKP4-204ENST00000421462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 USP47Q96K76 1375 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 BACH2Q9BYV9 841 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP4-204ENST00000421462 HECW1Q76N89 1606 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 GRIN2BQ13224 1484 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.05■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 USP35Q9P2H5 1018 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP4-204ENST00000421462 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 GSE1Q14687 1217 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 PKD2Q13563 968 aa22■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 NFKBIBQ15653 356 aa22■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 CRBNQ96SW2 442 aa22■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.99■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 PRDM2Q13029 1718 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.96■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 TOPBP1Q92547 1522 aa21.96■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
PKP4-204ENST00000421462 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 NESP48681 1621 aa21.94■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.94■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 MS4A1P11836 297 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 KIF15Q9NS87 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.93■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 MIA2Q96PC5 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 CUL7Q14999 1698 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 DAPK1P53355 1430 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP4-204ENST00000421462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.89■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 ABCC5O15440 1437 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 RALBP1Q15311 655 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.87■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 SAMD9Q5K651 1589 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 ARXQ96QS3 562 aa21.86■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 ARHGEF11O15085 1522 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 NLRP13Q86W25 1043 aa21.84■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 RGL3Q3MIN7 710 aa21.83■■□□□ 1.09
PKP4-204ENST00000421462 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PKP4-204ENST00000421462 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PKP4-204ENST00000421462 PDE3BQ13370 1112 aa21.79■■□□□ 1.08
PKP4-204ENST00000421462 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PKP4-204ENST00000421462 PZPP20742 1482 aa21.78■■□□□ 1.08
PKP4-204ENST00000421462 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 ROCK1Q13464 1354 aa21.76■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.75■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 NUP155O75694 1391 aa21.75■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 KDM5CP41229 1560 aa21.73■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 FAM161AQ3B820 660 aa21.72■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.71■■□□□ 1.07
PKP4-204ENST00000421462 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PKP4-204ENST00000421462 C8orf34Q49A92 452 aa21.69■■□□□ 1.06
PKP4-204ENST00000421462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.69■■□□□ 1.06
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