RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.59■■□□□ 1.05
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PTPRN2-205ENST00000409483 STK26Q9P289 416 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF3BO15066 747 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 27.2
PTPRN2-205ENST00000409483 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 NESP48681 1621 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN2-205ENST00000409483 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRN2-205ENST00000409483 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 SOX12O15370 315 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 KANK1Q14678 1352 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRN2-205ENST00000409483 MORC1Q86VD1 984 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 PRXQ9BXM0 1461 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN2-205ENST00000409483 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 CUX1P39880 1505 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 NUDCQ9Y266 331 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 RALBP1Q15311 655 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-205ENST00000409483 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRN2-205ENST00000409483 USP47Q96K76 1375 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 NLRP13Q86W25 1043 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 PANK3Q9H999 370 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 PTPRGP23470 1445 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 NCOA2Q15596 1464 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 TOP2BQ02880 1626 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 UACAQ9BZF9 1416 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRN2-205ENST00000409483 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 PLIN1O60240 522 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 BECN1Q14457 450 aa21.33■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.31■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.31■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 A0A0G2JS52 829 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRN2-205ENST00000409483 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.29■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.28■■□□□ 1
PTPRN2-205ENST00000409483 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.27■■□□□ 1
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PTPRN2-205ENST00000409483 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC7Q96M83 1385 aa21.24■□□□□ 0.99
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PTPRN2-205ENST00000409483 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF15Q9NS87 1388 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 GOLGA2Q08379 1002 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRN2-205ENST00000409483 TOPBP1Q92547 1522 aa21.21■□□□□ 0.99
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PTPRN2-205ENST00000409483 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 NUTM2FA1L443 756 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC184Q52MB2 194 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.18■□□□□ 0.98
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PTPRN2-205ENST00000409483 PRDM2Q13029 1718 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRN2-205ENST00000409483 AFAP1Q8N556 730 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 TIAM1Q13009 1591 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 HMGXB3Q12766 1538 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.978e-7■■■□□ 16.5
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PTPRN2-205ENST00000409483 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 APAF1O14727 1248 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 WDR97A6NE52 1622 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 GRIN2BQ13224 1484 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 PDE3BQ13370 1112 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRN2-205ENST00000409483 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.08■□□□□ 0.97
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