RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXD1Q16676 465 aa14.43□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC184Q52MB2 194 aa14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.42□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.4□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCER2I3L3R5 266 aa14.4□□□□□ -0.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.39□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 NESP48681 1621 aa14.38□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K1Q13233 1512 aa14.38□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.37□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 NFKBIBQ15653 356 aa14.36□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.36□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.34□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.33□□□□□ -0.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.33□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.33□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.31□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAIPQ13075 1403 aa14.3□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.3□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 UACAQ9BZF9 1416 aa14.3□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM2Q13029 1718 aa14.29□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCOA2Q15596 1464 aa14.29□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 HFM1A2PYH4 1435 aa14.28□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOPBP1Q92547 1522 aa14.27□□□□□ -0.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.27□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.26□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 FMN1Q68DA7 1419 aa14.25□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRS2Q9HD23 443 aa14.25□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.25□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 KDM6BO15054 1643 aa14.24□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 STAC3Q96MF2 364 aa14.23□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.23□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.23□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.22□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC4A3P48751 1232 aa14.22□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.21□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.21□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.21□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.21□□□□□ -0.13
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.21□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.19□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.19□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLCN1P35523 988 aa14.17□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRIN2BQ13224 1484 aa14.16□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 C14orf37Q86TY3 774 aa14.15□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.15□□□□□ -0.14
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNA4P22459 653 aa14.14□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE4AP27815 886 aa14.14□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC7Q96M83 1385 aa14.13□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.13□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CUL7Q14999 1698 aa14.13□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.12□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.11□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 VGLL3A8MV65 326 aa14.11□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 AKNAQ7Z591 1439 aa14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 POGKQ9P215 609 aa14.1□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAMD9Q5K651 1589 aa14.09□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
APOBEC3C-201ENST00000361441 BACH2Q9BYV9 841 aa14.08□□□□□ -0.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.07□□□□□ -0.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARID3AQ99856 593 aa14.07□□□□□ -0.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.06□□□□□ -0.16
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