RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 RALBP1Q15311 655 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC184Q52MB2 194 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 ARXQ96QS3 562 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 TMF1P82094 1093 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 HFM1A2PYH4 1435 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 CDCA8Q53HL2 280 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 USP47Q96K76 1375 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 NLRP13Q86W25 1043 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 HMGXB3Q12766 1538 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 NEUROD2Q15784 382 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-201ENST00000345512 MAPKBP1O60336 1514 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-201ENST00000345512 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 KIF15Q9NS87 1388 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 NAIPQ13075 1403 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 BECN1Q14457 450 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 MAP3K1Q13233 1512 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 PDE3BQ13370 1112 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 MSH5O43196 834 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-201ENST00000345512 PLIN1O60240 522 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 PDE4AP27815 886 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRU-201ENST00000345512 AKNAQ7Z591 1439 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 PANK3Q9H999 370 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 JPH4Q96JJ6 628 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 NESP48681 1621 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 TOPBP1Q92547 1522 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 ERCC6Q03468 1493 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP53Q96M91 514 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA2Q08379 1002 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 CRBNQ96SW2 442 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRU-201ENST00000345512 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.85e-6■■■■□ 20.5
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 SLC4A3P48751 1232 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 MIA2Q96PC5 1412 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 PTPRKQ15262 1439 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRU-201ENST00000345512 MS4A1P11836 297 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 SLC24A1O60721 1099 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 USP35Q9P2H5 1018 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 RSPH4AQ5TD94 716 aa20■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 MORC1Q86VD1 984 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRU-201ENST00000345512 DAPK1P53355 1430 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 NCOA1Q15788 1441 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 FAM161AQ3B820 660 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 PRDM2Q13029 1718 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 KANK1Q14678 1352 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.9■□□□□ 0.78
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