RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295984.7

PRRT3-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRRT3, Length 3,368 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-201ENST00000295984 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 NAIPQ13075 1403 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 GSE1Q14687 1217 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT3-201ENST00000295984 BACH2Q9BYV9 841 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 NFKBIBQ15653 356 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 FMN1Q68DA7 1419 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 HFM1A2PYH4 1435 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 TOPBP1Q92547 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 NCOA1Q15788 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRT3-201ENST00000295984 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 USP35Q9P2H5 1018 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 NCOA2Q15596 1464 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 RGS3P49796 1198 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 MAP3K1Q13233 1512 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 CRBNQ96SW2 442 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT3-201ENST00000295984 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 RGL3Q3MIN7 710 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.17■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT3-201ENST00000295984 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 USP47Q96K76 1375 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 KDM6BO15054 1643 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRT3-201ENST00000295984 ERCC6Q03468 1493 aa20.08■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 MS4A1P11836 297 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 POGKQ9P215 609 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 PKD2Q13563 968 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.02■□□□□ 0.8
PRRT3-201ENST00000295984 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PRRT3-201ENST00000295984 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20■□□□□ 0.79
PRRT3-201ENST00000295984 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PRRT3-201ENST00000295984 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PRRT3-201ENST00000295984 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PRRT3-201ENST00000295984 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.94■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 FAM161AQ3B820 660 aa19.93■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.93■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 JPH4Q96JJ6 628 aa19.92■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 KIF15Q9NS87 1388 aa19.92■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.92■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 C8orf34Q49A92 452 aa19.91■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 NLRP13Q86W25 1043 aa19.91■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.9■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.89■□□□□ 0.78
PRRT3-201ENST00000295984 RALBP1Q15311 655 aa19.89■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.88■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.88■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 PRDM2Q13029 1718 aa19.88■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.87■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 SEC24BO95487 1268 aa19.86■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.85■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.85■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 TSPY4P0CV99 314 aa19.84■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 TSPY10P0CW01 314 aa19.84■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.84■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.84■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 PDE3BQ13370 1112 aa19.83■□□□□ 0.77
PRRT3-201ENST00000295984 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
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