RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 SAMD9Q5K651 1589 aa11.9□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HERC3-201ENST00000264345 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.89□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-201ENST00000264345 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-201ENST00000264345 FOXD1Q16676 465 aa11.86□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 NUP155O75694 1391 aa11.85□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 RALBP1Q15311 655 aa11.84□□□□□ -0.51
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HERC3-201ENST00000264345 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.83□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS12P58397 1594 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 CDCA8Q53HL2 280 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 PTPRKQ15262 1439 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 KIF15Q9NS87 1388 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 USP47Q96K76 1375 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 WDR62O43379 1518 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 PBRM1Q86U86 1689 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 SLC24A1O60721 1099 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 NUDCQ9Y266 331 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 ABCC5O15440 1437 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 GRIN2AQ12879 1464 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-201ENST00000264345 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 TMF1P82094 1093 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 NCOA1Q15788 1441 aa11.75□□□□□ -0.53
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HERC3-201ENST00000264345 SYNJ2O15056 1496 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0556O60303 1618 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 PDE3BQ13370 1112 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF11O15085 1522 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 RGL3Q3MIN7 710 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-201ENST00000264345 KANK1Q14678 1352 aa11.71□□□□□ -0.53
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HERC3-201ENST00000264345 KIF14Q15058 1648 aa11.71□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 NLRP13Q86W25 1043 aa11.7□□□□□ -0.54
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HERC3-201ENST00000264345 STAC3Q96MF2 364 aa11.67□□□□□ -0.54
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HERC3-201ENST00000264345 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.66□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC3-201ENST00000264345 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 ADGRL2O95490 1459 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC3-201ENST00000264345 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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