RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258198.6

DYNC1LI2-201, Transcript of dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYNC1LI2, Length 4,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2-201ENST00000258198 UACAQ9BZF9 1416 aa25.12■■□□□ 1.61
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2-201ENST00000258198 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.11■■□□□ 1.61
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KANK1Q14678 1352 aa25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2-201ENST00000258198 TIAM1Q13009 1591 aa25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PTPRGP23470 1445 aa25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NBR1Q14596 966 aa25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 GRIN2BQ13224 1484 aa25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CFAP53Q96M91 514 aa25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2-201ENST00000258198 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NEUROD2Q15784 382 aa24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 GGT6Q6P531 493 aa24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 RALBP1Q15311 655 aa24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2-201ENST00000258198 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KIF3BO15066 747 aa24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 POGKQ9P215 609 aa24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 USP47Q96K76 1375 aa24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PRDM2Q13029 1718 aa24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 HFM1A2PYH4 1435 aa24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NLRP13Q86W25 1043 aa24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.84■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NUDCQ9Y266 331 aa24.83■■□□□ 1.57
DYNC1LI2-201ENST00000258198 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.564e-6■■■■□ 21.9
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KIF15Q9NS87 1388 aa24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 IFT140Q96RY7 1462 aa24.81■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CCDC7Q96M83 1385 aa24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.8■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MORC1Q86VD1 984 aa24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MIA2Q96PC5 1412 aa24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MAP3K1Q13233 1512 aa24.78■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.77■■□□□ 1.56
DYNC1LI2-201ENST00000258198 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 RGS3P49796 1198 aa24.75■■□□□ 1.55
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DYNC1LI2-201ENST00000258198 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NAIPQ13075 1403 aa24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 STK26Q9P289 416 aa24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 WDR97A6NE52 1622 aa24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PANK3Q9H999 370 aa24.72■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.71■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MLECQ14165 292 aa24.71■■□□□ 1.55
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CUL7Q14999 1698 aa24.7■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 HECW1Q76N89 1606 aa24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.65■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.64■■□□□ 1.54
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PDE3BQ13370 1112 aa24.64■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 IQGAP2Q13576 1575 aa24.62■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 DAPK1P53355 1430 aa24.61■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 C14orf37Q86TY3 774 aa24.61■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 SYNJ2O15056 1496 aa24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 BECN1Q14457 450 aa24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.59■■□□□ 1.53
DYNC1LI2-201ENST00000258198 GOLGA2Q08379 1002 aa24.57■■□□□ 1.52
DYNC1LI2-201ENST00000258198 PLEKHG5O94827 1062 aa24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI2-201ENST00000258198 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI2-201ENST00000258198 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.525e-9■■■□□ 17.8
DYNC1LI2-201ENST00000258198 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI2-201ENST00000258198 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.56■■□□□ 1.52
DYNC1LI2-201ENST00000258198 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.55■■□□□ 1.52
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