RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC7Q96M83 1385 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 NAIPQ13075 1403 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 NEFMP07197 916 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDP1-201ENST00000075430 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 PLIN1O60240 522 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 SLC4A3P48751 1232 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 NUDCQ9Y266 331 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 MAP3K1Q13233 1512 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDP1-201ENST00000075430 HFM1A2PYH4 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-201ENST00000075430 RGL3Q3MIN7 710 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 PRDM2Q13029 1718 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 ERCC6Q03468 1493 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 PKD2Q13563 968 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 ARXQ96QS3 562 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 CUL7Q14999 1698 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-201ENST00000075430 PDE4AP27815 886 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 GRIN2BQ13224 1484 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-201ENST00000075430 JPH4Q96JJ6 628 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 NCOA1Q15788 1441 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 RGS3P49796 1198 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 USP47Q96K76 1375 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 TSPY4P0CV99 314 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 TSPY10P0CW01 314 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 24
CTDP1-201ENST00000075430 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-201ENST00000075430 KDM6BO15054 1643 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 CRBNQ96SW2 442 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 IQGAP2Q13576 1575 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CTDP1-201ENST00000075430 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 NUP155O75694 1391 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 BACH2Q9BYV9 841 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-201ENST00000075430 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 DAPK1P53355 1430 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 ABCC5O15440 1437 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 HECW1Q76N89 1606 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 SAMD9Q5K651 1589 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 NFKBIBQ15653 356 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 MIA2Q96PC5 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDP1-201ENST00000075430 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 IFT140Q96RY7 1462 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 NLRP13Q86W25 1043 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 PANK3Q9H999 370 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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