RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170476.7

Usp20-211, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp20, Length 4,970 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20-211ENSMUST00000170476 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa16.52■□□□□ 0.24
Usp20-211ENSMUST00000170476 Cux1P53564 1515 aa16.52■□□□□ 0.24
Usp20-211ENSMUST00000170476 NgefQ8CHT1 710 aa16.52■□□□□ 0.24
Usp20-211ENSMUST00000170476 Rsph4aQ8BYM7 716 aa16.52■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Fgd1P52734 960 aa16.51■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Map3k1P53349 1493 aa16.5■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 ArxO35085 564 aa16.49■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa16.48■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Top2bQ64511 1612 aa16.48■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Stk26Q99JT2 416 aa16.47■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Tdrd9Q14BI7 1383 aa16.47■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Zfp777B9EKF4 885 aa16.47■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Neurod2Q62414 383 aa16.46■□□□□ 0.23
Usp20-211ENSMUST00000170476 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.46■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa16.45■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 DaxxO35613 739 aa16.44■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Rock2P70336 1388 aa16.43■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Iqcf3Q9D498 203 aa16.43■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa16.42■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Psme1P97371 249 aa16.42■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Usp47Q8BY87 1376 aa16.42■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Naip1Q9QWK5 1403 aa16.42■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.42■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 PtprkP35822 1457 aa16.41■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Camsap1A2AHC3 1581 aa16.41■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Txndc2Q6P902 515 aa16.4■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Irx6Q9ER75 438 aa16.4■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ift140E9PY46 1464 aa16.4■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Fgd6Q69ZL1 1399 aa16.4■□□□□ 0.22
Usp20-211ENSMUST00000170476 Stard8Q8K031 1019 aa16.38■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Lamc3Q9R0B6 1581 aa16.38■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Apbb1Q9QXJ1 710 aa16.38■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Exoc6Q8R313 802 aa16.37■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Plb1Q3TTY0 1478 aa16.37■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa16.37■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 NudcO35685 332 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Arap1Q4LDD4 1452 aa16.36■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa16.35■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Usp20-211ENSMUST00000170476 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.33■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Zscan21Q07231 555 aa16.32■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Dcaf11Q91VU6 549 aa16.32■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa16.31■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Gm6268A2A3U9 297 aa16.31■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Vps8Q0P5W1 1427 aa16.31■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Crocc2F6XLV1 1638 aa16.31■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Prdm16A2A935 1275 aa16.3■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 CadpsQ80TJ1 1355 aa16.28■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 CenpjQ569L8 1344 aa16.28■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Trim30dE9PWL0 497 aa16.27■□□□□ 0.2
Usp20-211ENSMUST00000170476 Slc4a1apE9PX68 744 aa16.27■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Nsd2Q8BVE8 1365 aa16.27■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Gm14025A2AP89 1413 aa16.26■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa16.25■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa16.25■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Arhgap5P97393 1501 aa16.25■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa16.24■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Rwdd1Q9CQK7 243 aa16.24■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Fam163aQ8CAA5 168 aa16.24■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Tiam1Q60610 1591 aa16.24■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 SynmQ70IV5 1561 aa16.23■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Birc3O08863 600 aa16.22■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 ErbinQ80TH2 1402 aa16.22■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Pde4cQ3UEI1 686 aa16.22■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.21■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Golga2Q921M4 999 aa16.21■□□□□ 0.19
Usp20-211ENSMUST00000170476 Dapk1Q80YE7 1442 aa16.2■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Sox12Q04890 314 aa16.2■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Usp40Q8BWR4 1235 aa16.2■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa16.19■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa16.19■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Pank3Q8R2W9 370 aa16.19■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Shq1Q7TMX5 569 aa16.18■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa16.18■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Zfp644E9QA22 1323 aa16.18■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 CanxP35564 591 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Map3k5O35099 1380 aa16.16■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Plin1Q8CGN5 517 aa16.15■□□□□ 0.18
Usp20-211ENSMUST00000170476 Grin2aP35436 1464 aa16.14■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Map7O88735 730 aa16.12■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Fam184bQ0KK56 942 aa16.12■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa16.12■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Inpp5dQ9ES52 1191 aa16.12■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Il16O54824 1322 aa16.12■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Cd109Q8R422 1442 aa16.11■□□□□ 0.17
Usp20-211ENSMUST00000170476 Ap3b2Q9JME5 1082 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.5 ms