RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccnb3Q810T2 1396 aa36.74■■■■□ 3.47
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arid3cA6PWV5 409 aa36.66■■■■□ 3.46
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36.65■■■■□ 3.46
Lmo4-201ENSMUST00000120539 UbtfP25976 765 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adcy10Q8C0T9 1614 aa36.59■■■■□ 3.45
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rnf17Q99MV7 1640 aa36.58■■■■□ 3.45
Lmo4-201ENSMUST00000120539 A2mQ6GQT1 1474 aa36.53■■■■□ 3.44
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa36.52■■■■□ 3.44
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa36.52■■■■□ 3.44
Lmo4-201ENSMUST00000120539 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa36.52■■■■□ 3.44
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zfyve16Q80U44 1528 aa36.49■■■■□ 3.43
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ttc37F8VPK0 1563 aa36.45■■■■□ 3.43
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgap5P97393 1501 aa36.45■■■■□ 3.43
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa36.45■■■■□ 3.42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Caskin1Q6P9K8 1431 aa36.44■■■■□ 3.42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa36.41■■■■□ 3.42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Depdc5P61460 1591 aa36.4■■■■□ 3.42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa36.37■■■■□ 3.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tdrd9Q14BI7 1383 aa36.37■■■■□ 3.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AglF8VPN4 1532 aa36.33■■■■□ 3.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abca9Q8K449 1623 aa36.33■■■■□ 3.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa36.31■■■■□ 3.4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cfap74Q3UY96 1578 aa36.3■■■■□ 3.4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AdgbG3UZ78 1657 aa36.24■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trappc8E9PWG2 1437 aa36.23■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc3B2RX12 1523 aa36.23■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc5Q9R1X5 1436 aa36.23■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kidins220E9Q9B7 1793 aa36.22■■■■□ 3.39
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plekhh2Q8C115 1491 aa36.18■■■■□ 3.38
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mtus2Q3UHD3 1353 aa36.12■■■■□ 3.37
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Naip2Q9QUK4 1447 aa36.12■■■■□ 3.37
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hecw1Q8K4P8 1604 aa36.07■■■■□ 3.37
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa36.03■■■■□ 3.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa36.03■■■■□ 3.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kiaa0556Q8C753 1610 aa36.01■■■■□ 3.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cabp1Q9JLK7 227 aa36■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chic2Q9D9G3 165 aa36■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 UacaQ8CGB3 1411 aa35.99■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fndc1E9Q043 1732 aa35.99■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Il16O54824 1322 aa35.98■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mast1Q9R1L5 1570 aa35.96■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 SphkapQ6NSW3 1687 aa35.96■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fmn2Q9JL04 1578 aa35.95■■■■□ 3.35
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lemd3Q9WU40 921 aa35.94■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa35.94■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 OvosQ3UU35 1456 aa35.93■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Neurl4Q5NCX5 1563 aa35.92■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mier1Q5UAK0 511 aa35.91■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kdm5cP41230 1554 aa35.91■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rfx7F8VPJ6 1459 aa35.91■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mia2Q91ZV0 1396 aa35.9■■■■□ 3.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa35.88■■■■□ 3.33
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fhad1A6PWD2 1420 aa35.85■■■■□ 3.33
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hecw2Q6I6G8 1578 aa35.83■■■■□ 3.33
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Vps8Q0P5W1 1427 aa35.81■■■■□ 3.32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa35.81■■■■□ 3.32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Synj2Q9D2G5 1434 aa35.79■■■■□ 3.32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp10aO54827 1508 aa35.78■■■■□ 3.32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cul9Q80TT8 1865 aa35.74■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ptch1Q61115 1434 aa35.74■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dip2cE9PWR4 1557 aa35.73■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map3k5O35099 1380 aa35.72■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 RereQ80TZ9 1558 aa35.72■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Prdm16A2A935 1275 aa35.71■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NclP09405 707 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nos1Q9Z0J4 1429 aa35.67■■■■□ 3.3
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abca17E9PX95 1733 aa35.61■■■■□ 3.29
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ssh2Q5SW75 1423 aa35.61■■■■□ 3.29
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fhod3Q76LL6 1578 aa35.6■■■■□ 3.29
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Yeats2Q3TUF7 1407 aa35.59■■■■□ 3.29
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AlkP97793 1621 aa35.58■■■■□ 3.29
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa35.56■■■■□ 3.28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dnajc5gQ8C632 165 aa35.52■■■■□ 3.28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Qser1A2BIE1 1698 aa35.51■■■■□ 3.28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zfp644E9QA22 1323 aa35.47■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trpm2Q91YD4 1506 aa35.46■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trpm1Q2TV84 1622 aa35.45■■■■□ 3.27
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ube2uB1AUC4 352 aa35.43■■■■□ 3.26
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gli2Q0VGT2 1544 aa35.42■■■■□ 3.26
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plch2A2AP18 1501 aa35.39■■■■□ 3.26
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa35.39■■■■□ 3.26
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ShprhQ7TPQ3 1674 aa35.38■■■■□ 3.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NpatQ8BMA5 1420 aa35.37■■■■□ 3.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Naip6Q9JIB6 1403 aa35.37■■■■□ 3.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccer2J3QPU5 274 aa35.37■■■■□ 3.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cfap65Q3V0B4 1847 aa35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.4 ms