RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024779.14

Usp49-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp49, Length 8,252 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49-201ENSMUST00000024779 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP20,85■□□□□ 0,93
Usp49-201ENSMUST00000024779 Iffo2Q8R2V2 512 aa20,85■□□□□ 0,93
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20,84■□□□□ 0,93
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP20,84■□□□□ 0,93
Usp49-201ENSMUST00000024779 R3hcc1Q8BSI6 488 aa20,8■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 B4galnt3Q6L8S8 986 aa20,8■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 MecomP14404 1042 aa20,8■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mia2Q91ZV0 1396 aa20,79■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fam71e1A1L3C1 212 aa20,79■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Prm3Q62100 101 aa20,79■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Plin1Q8CGN5 517 aa20,78■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP20,77■□□□□ 0,92
Usp49-201ENSMUST00000024779 Vps53Q8CCB4 832 aa20,77■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 Q3TQI7 289 aaKnown RBP20,75■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 MsnP26041 577 aaKnown RBP20,74■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 Psme1P97371 249 aa20,73■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 CgnP59242 1191 aa20,73■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 RdxP26043 583 aaKnown RBP20,72■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP20,72■□□□□ 0,91
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tmf1B9EKI3 1091 aa20,7■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP20,69■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stk26Q99JT2 416 aa20,69■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tnnt1O88346 262 aa20,66■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP20,66■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chmp3Q9CQ10 224 aa20,66■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 NacadQ5SWP3 1504 aa20,65■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tpd52l1O54818 204 aa20,65■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tmco5bQ80X59 307 aa20,65■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 AU015836B2RUM3 263 aa20,65■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppm1fQ8CGA0 452 aa20,65■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP20,64■□□□□ 0,9
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tpm4Q6IRU2 248 aa20,63■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tomm22Q9CPQ3 142 aa20,63■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP20,62■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP20,62■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa20,62■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sox12Q04890 314 aa20,61■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP20,6■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa20,59■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Birc3O08863 600 aa20,59■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Brpf1B2RRD7 1212 aa20,58■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Txndc2Q6P902 515 aa20,58■□□□□ 0,89
Usp49-201ENSMUST00000024779 Golga3P55937 1487 aa20,58■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Baz1aO88379 1555 aa20,57■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP20,57■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 EspnQ9ET47 871 aa20,57■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP20,56■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mical1Q8VDP3 1048 aa20,56■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chmp5Q9D7S9 219 aa20,55■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccer1Q9CQL2 403 aa20,55■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 AknaQ80VW7 1404 aa20,55■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tpm2P58774 284 aa20,54■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20,54■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dnai1Q8C0M8 701 aa20,53■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Golga2Q921M4 999 aa20,52■□□□□ 0,88
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rundc1Q0VDN7 615 aa20,51■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ubap1lG3UW59 384 aa20,51■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Irx3P81067 507 aa20,5■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20,5■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa20,5■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP20,5■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gm21969J3QJZ1 289 aa20,49■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ddx11Q6AXC6 880 aa20,49■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20,49■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ecm2Q5FW85 670 aa20,48■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP20,48■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Atp6v1dP57746 247 aa20,48■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ciz1Q8VEH2 845 aa20,48■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 BccipQ9CWI3 316 aa20,48■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Map7d2A2AG50 781 aa20,47■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tpm1P58771 284 aa20,47■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20,46■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ap3b2Q9JME5 1082 aa20,46■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Znf330Q922H9 316 aa20,46■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Krt82Q99M74 516 aa20,46■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Paf1Q8K2T8 535 aa20,46■□□□□ 0,87
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pak3Q61036 559 aa20,45■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Slc4a3P16283 1227 aa20,45■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP20,45■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP20,45■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Becn1O88597 448 aa20,45■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lemd3Q9WU40 921 aa20,43■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gpatch11Q3UFS4 262 aa20,43■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ipo8Q7TMY7 1010 aa20,43■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Arid3cA6PWV5 409 aa20,42■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cspp1B2RX88 1205 aa20,41■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rsph4aQ8BYM7 716 aa20,41■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 GorabQ8BRM2 368 aa20,41■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dcaf11Q91VU6 549 aa20,4■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cluap1Q8R3P7 413 aa20,4■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rock2P70336 1388 aa20,4■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trim30aP15533 496 aa20,4■□□□□ 0,86
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zscan21Q07231 555 aa20,39■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP20,39■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP20,37■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP20,37■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Supt16hQ920B9 1047 aa20,37■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pkd2O35245 966 aa20,36■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa20,36■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pibf1E9Q6K3 756 aa20,36■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,6 ms