RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa27.35■■□□□ 1.97
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf17Q99MV7 1640 aa27.33■■□□□ 1.97
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp10dQ8K2X1 1416 aa27.32■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa27.31■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa27.31■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa27.3■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.29■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Caskin1Q6P9K8 1431 aa27.27■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf608Q56A10 1511 aa27.27■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Naip2Q9QUK4 1447 aa27.27■■□□□ 1.96
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm156Q58A37 223 aa27.23■■□□□ 1.95
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ak9G3UYQ4 1894 aa27.22■■□□□ 1.95
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plekhh2Q8C115 1491 aa27.21■■□□□ 1.95
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.21■■□□□ 1.95
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap5P97393 1501 aa27.2■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mia2Q91ZV0 1396 aa27.2■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa27.19■■□□□ 1.94
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc5Q9R1X5 1436 aa27.18■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fhad1A6PWD2 1420 aa27.17■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 UacaQ8CGB3 1411 aa27.17■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NefmP08553 848 aa27.15■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tdrd9Q14BI7 1383 aa27.14■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cfap74Q3UY96 1578 aa27.14■■□□□ 1.94
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vps8Q0P5W1 1427 aa27.14■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa27.13■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mtus2Q3UHD3 1353 aa27.12■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rfx7F8VPJ6 1459 aa27.11■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa27.1■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pprc1Q6NZN1 1644 aa27.1■■□□□ 1.93
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfyve16Q80U44 1528 aa27.06■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hecw1Q8K4P8 1604 aa27.06■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa27.04■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SphkapQ6NSW3 1687 aa27.04■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chic2Q9D9G3 165 aa27.03■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc3B2RX12 1523 aa27.03■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa27.02■■□□□ 1.92
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il16O54824 1322 aa27.01■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arid3cA6PWV5 409 aa27.01■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fmn2Q9JL04 1578 aa27.01■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cabp1Q9JLK7 227 aa27■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kidins220E9Q9B7 1793 aa26.99■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca9Q8K449 1623 aa26.99■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trappc8E9PWG2 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mast1Q9R1L5 1570 aa26.96■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa26.96■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Neurl4Q5NCX5 1563 aa26.93■■□□□ 1.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa26.93■■□□□ 1.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa26.92■■□□□ 1.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fhod3Q76LL6 1578 aa26.9■■□□□ 1.9
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NclP09405 707 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa26.87■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc37F8VPK0 1563 aa26.86■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AglF8VPN4 1532 aa26.86■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccer2J3QPU5 274 aa26.84■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Depdc5P61460 1591 aa26.82■■□□□ 1.88
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AlkP97793 1621 aa26.78■■□□□ 1.88
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa26.75■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa0556Q8C753 1610 aa26.72■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif21bQ9QXL1 1668 aa26.72■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa26.72■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ube2uB1AUC4 352 aa26.71■■□□□ 1.87
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AdgbG3UZ78 1657 aa26.7■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdm5cP41230 1554 aa26.69■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca17E9PX95 1733 aa26.69■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trpm2Q91YD4 1506 aa26.69■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 OvosQ3UU35 1456 aa26.68■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lemd3Q9WU40 921 aa26.66■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ssh2Q5SW75 1423 aa26.65■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prdm16A2A935 1275 aa26.65■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp644E9QA22 1323 aa26.62■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eid3Q3V124 375 aa26.61■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cul9Q80TT8 1865 aa26.6■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp10aO54827 1508 aa26.59■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map3k5O35099 1380 aa26.59■■□□□ 1.85
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nos1Q9Z0J4 1429 aa26.57■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mphosph9A6H5Y1 991 aa26.56■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hecw2Q6I6G8 1578 aa26.54■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RereQ80TZ9 1558 aa26.53■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TonslQ6NZL6 1363 aa26.52■■□□□ 1.84
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dip2cE9PWR4 1557 aa26.51■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa26.5■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ShprhQ7TPQ3 1674 aa26.49■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fndc1E9Q043 1732 aa26.49■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Asxl1P59598 1514 aa26.48■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myo5cE9Q1F5 1742 aa26.47■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptch1Q61115 1434 aa26.47■■□□□ 1.83
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