RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001700.6

Hoxc13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc13, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 BlmO88700 1416 aa29,54■■■□□ 2,32
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Naip1Q9QWK5 1403 aa29,52■■■□□ 2,32
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zfp91Q62511 572 aa29,51■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif20aP97329 887 aa29,5■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kank1E9Q238 1360 aa29,49■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Efcab5A0JP43 1406 aa29,49■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 TnikP83510 1323 aa29,47■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mia2Q91ZV0 1396 aa29,46■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Vps8Q0P5W1 1427 aa29,46■■■□□ 2,31
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP29,45■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP29,44■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ppm1gQ61074 542 aa29,43■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa29,42■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29,42■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa29,42■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 NudcO35685 332 aaKnown RBP29,41■■■□□ 2,3
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dusp27Q148W8 1138 aa29,38■■■□□ 2,29
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29,35■■■□□ 2,29
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP29,35■■■□□ 2,29
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP29,34■■■□□ 2,29
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP29,34■■■□□ 2,29
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa29,32■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP29,31■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Vgll3P85442 326 aa29,31■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Crocc2F6XLV1 1638 aa29,3■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cul7Q8VE73 1689 aa29,3■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Slx4Q6P1D7 1565 aa29,29■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP29,27■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP29,27■■■□□ 2,28
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 IbspQ61711 324 aa29,26■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Disp1Q3TDN0 1521 aa29,24■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 EspnQ9ET47 871 aa29,24■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 PogkQ80TC5 607 aa29,23■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 NrkQ9R0G8 1455 aa29,23■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP29,22■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Spryd3E9Q9B3 442 aa29,22■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Irf5P56477 497 aa29,21■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP29,21■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dbr1Q923B1 550 aa29,21■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 PtprkP35822 1457 aa29,21■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Htatsf1Q8BGC0 757 aa29,2■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Stard8Q8K031 1019 aa29,2■■■□□ 2,27
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cul9Q80TT8 1865 aa29,2■■■□□ 2,26
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Camsap1A2AHC3 1581 aa29,19■■■□□ 2,26
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Naip2Q9QUK4 1447 aa29,18■■■□□ 2,26
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 TimelessQ9R1X4 1197 aa29,18■■■□□ 2,26
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Erich3F6QRE9 1637 aa29,13■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ube2uB1AUC4 352 aa29,13■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lmod2Q3UHZ5 550 aa29,13■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP29,12■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29,12■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pcf11G3X9Z4 1553 aa29,09■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chmp5Q9D7S9 219 aa29,09■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP29,08■■■□□ 2,25
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa29,07■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Clcn1Q64347 994 aa29,06■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tpm2P58774 284 aa29,04■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Map3k1P53349 1493 aa29,03■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Il4rP16382 810 aa29,03■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plekhg5Q66T02 1073 aa29,02■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ankrd26Q811D2 1581 aa29,02■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP29,02■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP29,02■■■□□ 2,24
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP29,01■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ak9G3UYQ4 1894 aa29,01■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ipo8Q7TMY7 1010 aa29■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fam43aQ8BUP8 424 aa29■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm6268A2A3U9 297 aa28,99■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ak7Q9D2H2 614 aa28,99■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Myom3A2ABU4 1439 aa28,96■■■□□ 2,23
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abca5Q8K448 1642 aa28,94■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fhod3Q76LL6 1578 aa28,94■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trim30dE9PWL0 497 aa28,94■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rock2P70336 1388 aa28,93■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Antxr1Q9CZ52 562 aa28,93■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28,92■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmc1Q8R4P5 757 aa28,92■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ripk4Q9ERK0 786 aa28,91■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 ArxO35085 564 aa28,91■■■□□ 2,22
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28,88■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28,88■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mcm4P49717 862 aa28,87■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28,87■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mphosph9A6H5Y1 991 aa28,87■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP28,87■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Usp47Q8BY87 1376 aa28,87■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trim26Q99PN3 545 aa28,86■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28,86■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 A2mQ6GQT1 1474 aa28,86■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28,85■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ddrgk1Q80WW9 315 aa28,85■■■□□ 2,21
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP28,82■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 SynmQ70IV5 1561 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP28,81■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tnnt2P50752 301 aa28,81■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Peg3Q3URU2 1571 aa28,81■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa28,81■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54,1 ms