Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61,84■■■■■ 7,49
Cul7Q8VE73 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57,72■■■■■ 6,83
Cul7Q8VE73 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,26■■■■■ 6,6
Cul7Q8VE73 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54,19■■■■■ 6,27
Cul7Q8VE73 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53,46■■■■■ 6,15
Cul7Q8VE73 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52,5■■■■■ 5,99
Cul7Q8VE73 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,32■■■■■ 5,97
Cul7Q8VE73 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,07■■■■■ 5,93
Cul7Q8VE73 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,92■■■■■ 5,9
Cul7Q8VE73 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51,81■■■■■ 5,88
Cul7Q8VE73 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51,43■■■■■ 5,82
Cul7Q8VE73 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50,57■■■■■ 5,69
Cul7Q8VE73 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50,08■■■■■ 5,61
Cul7Q8VE73 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,95■■■■■ 5,59
Cul7Q8VE73 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49,93■■■■■ 5,58
Cul7Q8VE73 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,64■■■■■ 5,54
Cul7Q8VE73 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,55■■■■■ 5,52
Cul7Q8VE73 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,41■■■■■ 5,5
Cul7Q8VE73 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,29■■■■■ 5,48
Cul7Q8VE73 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,07■■■■■ 5,45
Cul7Q8VE73 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49,06■■■■■ 5,44
Cul7Q8VE73 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC49,01■■■■■ 5,44
Cul7Q8VE73 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48,94■■■■■ 5,42
Cul7Q8VE73 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,7■■■■■ 5,39
Cul7Q8VE73 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,3■■■■■ 5,32
Cul7Q8VE73 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48,08■■■■■ 5,29
Cul7Q8VE73 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47,95■■■■■ 5,27
Cul7Q8VE73 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,91■■■■■ 5,26
Cul7Q8VE73 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47,8■■■■■ 5,24
Cul7Q8VE73 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,64■■■■■ 5,22
Cul7Q8VE73 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,61■■■■■ 5,21
Cul7Q8VE73 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
Cul7Q8VE73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,53■■■■■ 5,2
Cul7Q8VE73 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,42■■■■■ 5,18
Cul7Q8VE73 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,41■■■■■ 5,18
Cul7Q8VE73 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47,35■■■■■ 5,17
Cul7Q8VE73 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47,26■■■■■ 5,16
Cul7Q8VE73 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47,19■■■■■ 5,14
Cul7Q8VE73 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47■■■■■ 5,11
Cul7Q8VE73 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,76■■■■■ 5,08
Cul7Q8VE73 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46,66■■■■■ 5,06
Cul7Q8VE73 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46,65■■■■■ 5,06
Cul7Q8VE73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,6■■■■■ 5,05
Cul7Q8VE73 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46,55■■■■■ 5,04
Cul7Q8VE73 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46,51■■■■■ 5,04
Cul7Q8VE73 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,42■■■■■ 5,02
Cul7Q8VE73 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,3■■■■■ 5
Cul7Q8VE73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC46,2■■■■■ 4,99
Cul7Q8VE73 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,18■■■■■ 4,98
Cul7Q8VE73 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46,16■■■■■ 4,98
Cul7Q8VE73 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46,11■■■■■ 4,97
Cul7Q8VE73 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,1■■■■■ 4,97
Cul7Q8VE73 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46,1■■■■■ 4,97
Cul7Q8VE73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC46,04■■■■■ 4,96
Cul7Q8VE73 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46,02■■■■■ 4,96
Cul7Q8VE73 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45,91■■■■■ 4,94
Cul7Q8VE73 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,9■■■■■ 4,94
Cul7Q8VE73 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45,85■■■■■ 4,93
Cul7Q8VE73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45,83■■■■■ 4,93
Cul7Q8VE73 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,8■■■■■ 4,92
Cul7Q8VE73 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45,73■■■■■ 4,91
Cul7Q8VE73 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45,68■■■■■ 4,9
Cul7Q8VE73 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,57■■■■■ 4,89
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45,47■■■■■ 4,87
Cul7Q8VE73 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,4■■■■■ 4,86
Cul7Q8VE73 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45,36■■■■■ 4,85
Cul7Q8VE73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45,36■■■■■ 4,85
Cul7Q8VE73 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45,17■■■■■ 4,82
Cul7Q8VE73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45,04■■■■■ 4,8
Cul7Q8VE73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Cul7Q8VE73 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Cul7Q8VE73 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45,01■■■■■ 4,8
Cul7Q8VE73 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Cul7Q8VE73 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44,95■■■■■ 4,79
Cul7Q8VE73 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44,92■■■■■ 4,78
Cul7Q8VE73 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,88■■■■■ 4,78
Cul7Q8VE73 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,74■■■■■ 4,75
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44,74■■■■■ 4,75
Cul7Q8VE73 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Cul7Q8VE73 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Cul7Q8VE73 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,56■■■■■ 4,72
Cul7Q8VE73 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,56■■■■■ 4,72
Cul7Q8VE73 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,49■■■■■ 4,71
Cul7Q8VE73 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44,47■■■■■ 4,71
Cul7Q8VE73 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44,46■■■■■ 4,71
Cul7Q8VE73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44,45■■■■■ 4,71
Cul7Q8VE73 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44,28■■■■■ 4,68
Cul7Q8VE73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44,27■■■■■ 4,68
Cul7Q8VE73 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44,27■■■■■ 4,68
Cul7Q8VE73 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,23■■■■■ 4,67
Cul7Q8VE73 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Cul7Q8VE73 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,12■■■■■ 4,65
Cul7Q8VE73 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,11■■■■■ 4,65
Cul7Q8VE73 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Cul7Q8VE73 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,08■■■■■ 4,65
Cul7Q8VE73 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,04■■■■■ 4,64
Cul7Q8VE73 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Cul7Q8VE73 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44,02■■■■■ 4,64
Cul7Q8VE73 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Cul7Q8VE73 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms