RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-DR4O74302 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA COX6P00427 148 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-AP0CX57 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-ORP0CX59 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-JR2P47099 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-DR1Q03856 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-BRQ12217 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-NL2Q12470 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA TY1A-GR2Q12485 440 aa6.87□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA LAM6Q08001 693 aa6.85□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA DMA1P38823 416 aa6.84□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA YPR109WQ06104 294 aa6.84□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA RGR1P19263 1082 aa6.82□□□□□ -1.32
15S_rRNA15S_rRNA FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
15S_rRNA15S_rRNA MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
15S_rRNA15S_rRNA RRN7P40992 514 aa6.8□□□□□ -1.32
15S_rRNA15S_rRNA BDP1P46678 594 aa6.78□□□□□ -1.32
15S_rRNA15S_rRNA PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA ERF2Q06551 359 aa6.76□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA KEX2P13134 814 aa6.75□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA CKB1P43639 278 aa6.73□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA PBS2P08018 668 aa6.72□□□□□ -1.33
15S_rRNA15S_rRNA HED1Q03937 162 aa6.7□□□□□ -1.34
15S_rRNA15S_rRNA RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
15S_rRNA15S_rRNA TRK2P28584 889 aa6.66□□□□□ -1.34
15S_rRNA15S_rRNA PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
15S_rRNA15S_rRNA ASH1P34233 588 aa6.65□□□□□ -1.34
15S_rRNA15S_rRNA PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA DSF2P38213 736 aa6.64□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA MAM3Q12296 706 aa6.64□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA MOD5P07884 428 aa6.63□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA CAF120P53836 1060 aa6.63□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA TUB4P53378 473 aa6.62□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA PUS5Q06244 254 aa6.62□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA IES2P40154 320 aa6.61□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA AGE1Q04412 482 aa6.61□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA MET32Q12041 191 aa6.61□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
15S_rRNA15S_rRNA CLB5P30283 435 aa6.58□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA HST3P53687 447 aa6.57□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA YNL115CP53925 644 aa6.57□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA AFT1P22149 690 aa6.56□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.56□□□□□ -1.36not detected
15S_rRNA15S_rRNA DIT2P21595 489 aa6.55□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA YGR035CP53222 116 aa6.55□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA RTF1P53064 558 aa6.54□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA ACO2P39533 789 aa6.54□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA SIT4P20604 311 aa6.53□□□□□ -1.36
15S_rRNA15S_rRNA TEA1P47988 759 aa6.52□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA YJR115WP47152 169 aa6.51□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA KXD1P53158 218 aa6.5□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA NIS1P53939 407 aa6.5□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA HXT10P43581 546 aa6.47□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA ICP55P40051 511 aa6.47□□□□□ -1.37
15S_rRNA15S_rRNA SLY41P22215 453 aa6.46□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA TPD3P31383 635 aa6.45□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA HPF1Q05164 967 aa6.44□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA FPK1P53739 893 aa6.43□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
15S_rRNA15S_rRNA UGA3P26370 528 aa6.39□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA YMR196WQ04336 1088 aa6.39□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA SCJ1P25303 377 aa6.39□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA PUS6P53294 404 aa6.39□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA KIP2P28743 706 aa6.38□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA ALR1Q08269 859 aa6.37□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA YDL206WQ12424 762 aa6.37□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA RPA14P50106 137 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA OPT2Q06593 877 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA GLC3P32775 704 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA YIR007WP40566 764 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA TBF1Q02457 562 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA YPR097WQ06839 1073 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA SRF1Q12516 437 aa6.36□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA IXR1P33417 597 aa6.35□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
15S_rRNA15S_rRNA ATF2P53296 535 aa6.33□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA YLR346CQ06139 101 aa6.33□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA YPR204WQ08995 1032 aa6.33□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA HST2P53686 357 aa6.32□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
15S_rRNA15S_rRNA MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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