RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J PET130P47065 347 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J JHD2P47156 728 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ATF2P53296 535 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD32P53323 261 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR209CQ03648 457 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR155WQ03795 547 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ROY1Q04847 553 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BCH1Q05029 724 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BSC2Q05611 235 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM30Q05930 598 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP13Q05946 817 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BOP2Q06150 570 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR177WQ06251 628 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CDA1Q06702 301 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC13Q08630 104 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG29Q12092 213 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J APC9Q12107 265 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TMS1Q12116 473 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR022CQ12139 1133 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MDY2Q12285 212 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL247CQ12523 523 aa2.52□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL7AP05737 244 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J LEU4P06208 619 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J STE3P06783 470 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HOP09932 586 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL43BP0CX26 92 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP5P12868 1029 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL25P23369 157 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP2P24783 546 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MGR1P25573 417 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE1P27616 306 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM5P29496 775 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT4P32467 576 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL100CP34248 587 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS27AP35997 82 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KKQ8P36004 724 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP14P36080 434 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO89P38361 574 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS27BP38711 82 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP9P38882 575 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT7P39004 570 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SSP120P39931 234 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP8P40335 379 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J APQ12P40532 138 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MNT3P40549 630 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MAD2P40958 196 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BAP3P41815 604 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data2.51□□□□□ -2.01not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J STB2P46679 850 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL176CP46945 554 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ROG1P53118 685 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BIO4P53630 237 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UBX4P54730 416 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPP2Q02521 185 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RMI1Q02685 241 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MET31Q03081 177 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RRN11Q04712 507 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VID22Q05934 901 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CDA2Q06703 312 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J REH1Q06709 432 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL024WQ08172 172 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PUS7Q08647 676 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TPO4Q12256 659 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP42Q12329 375 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RGS2Q99188 309 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NHA1Q99271 985 aa2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BRR2P32639 2163 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UBR1P19812 1950 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC8P00572 216 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM2P05373 342 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COR1P07256 457 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC26P14724 124 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC62P21825 274 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SGV1P23293 657 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NAR1P23503 491 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SBA1P28707 216 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CRM1P30822 1084 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FUN30P31380 1131 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SRB5P32585 307 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KAP122P32767 1081 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms