RNA–Protein interactions for RNA: YOL082W

ATG19, Transcript of Receptor protein for the cytoplasm-to-vacuole targeting (Cvt) pathway, yeast

Gene ATG19, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG19	YOL082W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG19	YOL082W	AYT1	Q12226	474 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG19	YOL082W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	AAC3	P18238	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SAN1	P22470	610 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TOF2	Q02208	771 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	COQ9	Q05779	260 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	THP1	Q08231	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YCR007C	P25354	239 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	FRE1	P32791	686 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SHP1	P34223	423 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YJL132W	P47014	750 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RCN2	Q12044	265 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SUC2	P00724	532 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	UTR4	P32626	227 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YBR139W	P38109	508 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YBP1	P38315	674 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SHO1	P40073	367 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TMA108	P40462	946 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	PHO92	Q06390	306 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	CTI6	Q08923	506 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	HEM2	P05373	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	CBS2	P14905	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YCR022C	P25620	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	PEP3	P27801	918 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	PMU1	P36069	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	BNA4	P38169	460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	REG2	P38232	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	MSR1	P38714	643 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	MRX6	P48564	524 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YGR066C	P53242	292 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	IRC15	Q02733	499 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	VPS74	Q06385	345 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RLM1	Q12224	676 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	ATR1	P13090	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	EXO70	P19658	623 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	ELO2	P25358	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TUL1	P36096	758 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	DUG2	P38149	878 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	ALG8	P40351	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
ATG19	YOL082W	BOR1	P53838	576 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	VPS38	Q05919	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	TLG2	Q08144	397 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	RSA1	Q08932	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	CBS1	P14066	229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YME1	P32795	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	MSN2	P33748	704 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YOX1	P34161	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	AVT5	P38176	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	AIM22	P47051	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	GPI1	P53306	609 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	FIN1	Q03898	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	AVL9	Q12500	764 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG19	YOL082W	GAL80	P04387	435 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	PCA1	P38360	1216 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	IDP2	P41939	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	ELP2	P42935	788 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	PRD1	P25375	712 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	SDS24	P38314	527 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	HAT2	P39984	401 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
ATG19	YOL082W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	WSC2	P53832	503 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	VPS75	P53853	264 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	GCN4	P03069	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	COR1	P07256	457 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	MUM2	P38236	366 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	MBB1	P39534	108 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	GWT1	P47026	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	CTF3	Q12748	733 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	RAV1	P47104	1357 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG19	YOL082W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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