RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W TY1A-BRQ12217 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-NL2Q12470 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TY1A-GR2Q12485 440 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CKA1P15790 372 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W AAC3P18238 307 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NPL6P32832 435 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HES1P35843 434 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SWH1P35845 1188 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
SIN3YOL004W YHR112CP38716 378 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YHR218WP38899 603 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RCO1Q04779 684 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TPK1P06244 397 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SEC61P32915 480 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YBR225WP38321 900 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SSP120P39931 234 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SBH2P52871 88 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARP5P53946 755 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YMR087WQ04299 284 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CDC16P09798 840 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PRY2P36110 329 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TAE1P38340 232 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RIM11P38615 370 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TOK1P40310 691 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YIR007WP40566 764 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TMA10Q06177 86 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YOR019WQ99248 730 aa2.83□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W REP1P03871 373 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SLY1P22213 666 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W OCA4P25366 362 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LOT5P34234 306 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TIF11P38912 153 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RTT105P40063 208 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YER186CP40101 306 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PCL7P40186 285 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RIC1P40395 1056 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ERR3P42222 437 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CHA4P43634 648 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MNT2P53059 558 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YLR446WQ06204 433 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YOR111WQ99210 232 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W KIN28P06242 306 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CTA1P15202 515 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SRV2P17555 526 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CLB3P24870 427 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DAL80P26343 269 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W IME2P32581 645 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MTH1P35198 433 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W VPS51P36116 164 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MNL1P38888 796 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DSE4P53753 1117 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ASI1P54074 624 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W FCY22Q12119 530 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DCS2Q12123 353 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ECM29P38737 1868 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YLR302CO13544 120 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PRO1P32264 428 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MTC7P32633 139 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YAR028WP39548 234 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LEM3P42838 414 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YGR079WP53249 370 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SGT1Q08446 395 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W VPS68Q12016 184 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa2.82□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SEC2P17065 759 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SET5P38890 526 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ARH1P48360 493 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ZRG17P53735 605 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HLR1Q04429 423 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CUR1Q06469 252 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W XYL2Q07993 356 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MCH5Q08777 521 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PGC1Q08959 321 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MSS18P08593 268 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YML002WP0CF17 737 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SPO16P17122 198 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RTG1P32607 177 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CIS3P47001 227 aa2.81□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YPR089WO13585 888 aa2.81□□□□□ -1.96
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