RNA–Protein interactions for RNA: YLR467W

YRF1-5, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-5, Length 5,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5YLR467W NDT80P38830 627 aa7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RPH1P39956 796 aa7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W LSM5P40089 93 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W LSM8P47093 109 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W GTO1P48239 356 aa7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ASI3P53983 676 aa7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W DUS4Q06063 367 aa7.56□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RIM15P43565 1770 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YBL010CP32788 280 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YFL012WP43580 148 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W AVT1P47082 602 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W DIA3P52290 468 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W NSG2P53898 299 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W GPN3Q06543 272 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ACF2Q12168 779 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W APT2P36973 181 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W BIT2P38346 545 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W COS8P38723 381 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SSO2P39926 295 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SPP1Q03012 353 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YPR172WQ06608 200 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RIB3Q99258 208 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W PEP4P07267 405 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ECM8P38246 354 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YGR210CP42942 411 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YKL100CP34248 587 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W FHL1P39521 936 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ASN2P49090 572 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W URA3P03962 267 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RAD52P06778 471 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W TMT1P32643 299 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YPT7P32939 208 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YHK8P38776 514 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ERP2P39704 215 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W EXO1P39875 702 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ARH1P48360 493 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YPR003CP53394 754 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W EFM6P53970 246 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W GSH2Q08220 491 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YOL131WQ08270 108 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W UTR4P32626 227 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W MRPL17P36528 281 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W AIM2P39721 246 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YBR063CP38083 404 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RSP5P39940 809 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YEL020CP39994 560 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RET2P43621 546 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RMI1Q02685 241 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YPL071CQ02864 156 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YMD8Q03697 442 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YPS7Q06325 596 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RAS2P01120 322 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W CIN8P27895 1000 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W AAD4Q07747 329 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W AVO1Q08236 1176 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YOL159CQ08300 171 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W PST2Q12335 198 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W TUB2P02557 457 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RER1P25560 188 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W NAM9P27929 486 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W BIO2P32451 375 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SDH8P38345 138 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W DOT5P40553 215 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SNX41Q04053 625 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W UBX5Q06682 500 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W MCD1Q12158 566 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W OCA4P25366 362 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YKR075CP36155 307 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W DBR1P24309 405 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RIM4P38741 713 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YAT2P40017 923 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SSY5P47002 699 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W PEX13P80667 386 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W TIM44Q01852 431 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W RRN5Q02983 363 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ASR1Q06834 288 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YDL121CQ07541 149 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W IZH4Q99393 312 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W HXT2P23585 541 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W CAM1P29547 415 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W ARO7P32178 256 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W PPQ1P32945 549 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W VID24P38263 362 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W UTP7P40055 554 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-5YLR467W GUF1P46943 645 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms