RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	BNA4	P38169	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YBR225W	P38321	900 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
OMA1	YKR087C	RTT101	P47050	842 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	IVY1	Q04934	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	PPT2	Q12036	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	FOB1	O13329	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	CYB2	P00175	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	NPR2	P39923	615 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SLD5	Q03406	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SET6	Q12529	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MET8	P15807	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	ATS1	P31386	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	IMP2'	P32351	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	FRE1	P32791	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	FIN1	Q03898	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SYO1	Q07395	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
OMA1	YKR087C	ELO2	P25358	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	UTR4	P32626	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	DUG2	P38149	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RPH1	P39956	796 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MFB1	Q04922	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	PHO92	Q06390	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	OCA4	P25366	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	BUD14	P27637	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	KRE9	P39005	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RPR2	P40571	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	AIM22	P47051	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	IRC15	Q02733	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	COR1	P07256	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	EXO70	P19658	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YCR007C	P25354	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	SPC110	P32380	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MSN2	P33748	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	CST26	P38226	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MBB1	P39534	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	YJL213W	P40896	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	PET130	P47065	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	GPI1	P53306	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	BNA5	Q05979	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	MED1	Q12321	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RRI2	Q12348	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OMA1	YKR087C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	PRD1	P25375	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	SHO1	P40073	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	TIM10	P87108	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	SCW10	Q04951	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	AYT1	Q12226	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	RAV1	P47104	1357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	YCR022C	P25620	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	YEL057C	P39983	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	SPO22	P40511	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	MET28	P40573	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	VPS74	Q06385	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	AGA1	P32323	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	MRE11	P32829	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
OMA1	YKR087C	POP1	P41812	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	ELP2	P42935	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	YDL186W	P48568	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	ARG3	P05150	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
OMA1	YKR087C	COS10	P52924	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19 ms