RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	TOF2	Q02208	771 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	SLD5	Q03406	294 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	IVY1	Q04934	453 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	SYO1	Q07395	620 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	THP1	Q08231	455 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	YDL009C	Q12210	107 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.85	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	CBS1	P14066	229 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	YCR007C	P25354	239 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	CPR3	P25719	182 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	PEP3	P27801	918 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	FRE1	P32791	686 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	BNA4	P38169	460 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	MSR1	P38714	643 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	YHR218W	P38899	603 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.84	□□□□□ -1.95	not detected
CSE4	YKL049C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.84	□□□□□ -1.95	not detected
CSE4	YKL049C	BNA5	Q05979	453 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	RLM1	Q12224	676 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	AVL9	Q12500	764 aa		2.84	□□□□□ -1.95
CSE4	YKL049C	SUC2	P00724	532 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	NPR2	P39923	615 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	AIM22	P47051	409 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	COS10	P52924	374 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	VPS75	P53853	264 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	FIN1	Q03898	291 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	VPS38	Q05919	439 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	AYT1	Q12226	474 aa		2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	GCN4	P03069	281 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	EXO70	P19658	623 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ELO2	P25358	347 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	AGA1	P32323	725 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	UTR4	P32626	227 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YME1	P32795	747 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	DUG2	P38149	878 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	SHO1	P40073	367 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PHO92	Q06390	306 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YDL121C	Q07541	149 aa		2.82	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	GAL80	P04387	435 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	HEM2	P05373	342 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
CSE4	YKL049C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MET8	P15807	274 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PRD1	P25375	712 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YCR022C	P25620	114 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	IMP2'	P32351	346 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MSN2	P33748	704 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PMU1	P36069	295 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	SRO77	P38163	1010 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	RMD8	P43620	662 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	GPI1	P53306	609 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	IRC15	Q02733	499 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	VPS74	Q06385	345 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	COR1	P07256	457 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ATR1	P13090	542 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	OCA4	P25366	362 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	TUL1	P36096	758 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MUM2	P38236	366 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YBP1	P38315	674 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YBR225W	P38321	900 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ALG8	P40351	577 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	DOT5	P40553	215 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ELP2	P42935	788 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YJL132W	P47014	750 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PET130	P47065	347 aa		2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	RAV1	P47104	1357 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	FOB1	O13329	566 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	HAT2	P39984	401 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MET28	P40573	187 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	GWT1	P47026	490 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YLL056C	Q12177	298 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	CBS2	P14905	389 aa		2.78	□□□□□ -1.96

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