RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	SEC61	P32915	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SRL3	P36167	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MNN1	P39106	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	IMA1	P53051	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RAD30	Q04049	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NUS1	Q12063	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	STB3	Q12427	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEM1	O94742	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ZIP1	P31111	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SFP1	P32432	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	LRG1	P35688	1017 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SLM4	P38247	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YEL073C	P39974	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FET5	P43561	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NUP85	P46673	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DIA3	P52290	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GET1	P53192	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ASI2	P53895	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	APC9	Q12107	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NSL1	Q12143	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YBR241C	P38142	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	AGP3	P43548	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PET130	P47065	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DSL1	P53847	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SPP2	Q02521	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DYN3	Q04949	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ORM2	Q06144	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	IES3	Q12345	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RED1	P14291	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	VAC17	P25591	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YHR182W	P38870	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FAA2	P39518	744 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MPH1	P40562	993 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ZIM17	P42844	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HXT16	P47185	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NRM1	P53718	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ZRG17	P53735	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HXT15	P54854	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BNA5	Q05979	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PFA4	Q12006	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UPC2	Q12151	913 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FAR1	P21268	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TIP20	P33891	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MRPL37	P36532	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PIM1	P36775	1133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SSN3	P39073	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DSS1	P39112	969 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YAL037W	P39728	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ECM9	Q02202	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FAR10	Q06001	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PHO5	P00635	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MSS18	P08593	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RSC6	P25632	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PUP2	P32379	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	THI80	P35202	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RRN3	P36070	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HAT2	P39984	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HPM1	P40481	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TFB3	Q03290	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HSP31	Q04432	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RSC3	Q06639	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ICT1	Q12385	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SWI5	P08153	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	KSS1	P14681	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CLB3	P24870	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FRE2	P36033	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UBA4	P38820	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SSU1	P41930	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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