RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SPO16P17122 198 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W UTR1P21373 530 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SEC62P21825 274 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ATP12P22135 325 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AEP2P22136 580 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GRR1P24814 1151 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YCR101CP25607 182 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PTP2P29461 750 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SIN4P32259 974 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DBF20P32328 564 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RCN1P36054 211 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TDA3P38758 523 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W LNP1P38878 278 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MNL1P38888 796 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FRT2P39734 528 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MIT1P40002 666 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MRX1P40050 688 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ASG1P40467 964 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HYR1P40581 163 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SKP2P42843 763 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GLG2P47011 380 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BNA2P47125 453 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AIM24P47127 394 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GTO1P48239 356 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ASE1P50275 885 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MND1P53102 219 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNT2P53127 1403 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SOL4P53315 255 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KTR6P54070 446 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ACS1Q01574 713 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MMT1Q03218 510 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BNA7Q04066 261 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GIM5Q04493 163 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W UFO1Q04511 668 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ULA1Q12059 462 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VPS54Q12071 889 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HUA2Q12134 243 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HOS1Q12214 470 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SKM1Q12469 655 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AVL9Q12500 764 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RAD61Q99359 647 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLR278CQ05854 1341 aa3.4□□□□□ -1.87
VFA1YER128W REV3P14284 1504 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CHS1P08004 1131 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MRP7P12687 371 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W POL3P15436 1097 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COX11P19516 300 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MBR1P23493 339 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CWH43P25618 953 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MCM10P32354 571 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GYP6P32806 458 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DID4P36108 232 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YKR015CP36111 568 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SBE22P38814 852 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPH1P39956 796 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CAB2P40506 365 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SER33P40510 469 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MEP2P41948 499 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YJR079WP47126 109 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RFX1P48743 811 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PRP24P49960 444 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NAS6P50086 228 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PCL10P53124 433 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YGR042WP53227 271 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MAL13P53338 473 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COS6P53344 381 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ZRG17P53735 605 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VPS9P54787 451 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PET117Q02771 107 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YML131WQ03102 365 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SNX41Q04053 625 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HFD1Q04458 532 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BCH1Q05029 724 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLR345WQ06137 509 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SFH1Q06168 426 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLR177WQ06251 628 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VPS74Q06385 345 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W THI3Q07471 609 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YDL086WQ07505 273 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLR001CQ07895 862 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NSE1Q07913 336 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SGT1Q08446 395 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPL216WQ08964 1102 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AKR2Q12013 749 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AIM41Q12032 185 aa3.39□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPR022CQ12139 1133 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.6 ms