RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	UAF30	Q08747	228 aa		10.88	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	COX3	P00420	269 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	CAF4	P36130	643 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	VHS1	Q03785	461 aa		10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	AI3	P03877	415 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.86	□□□□□ -0.67	not detected
RNQ1	YCL028W	ZIP1	P31111	875 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SEC61	P32915	480 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PFS1	P38872	237 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	GTO1	P48239	356 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	NAS6	P50086	228 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	IMA1	P53051	589 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	BCP1	Q06338	283 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	RTT10	Q08924	1013 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	ATG29	Q12092	213 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MHT1	Q12525	324 aa		10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	DST1	P07273	309 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	RED1	P14291	827 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PHO87	P25360	923 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	OCA4	P25366	362 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	FRE2	P36033	711 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	NDE1	P40215	560 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MEP2	P41948	499 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	COS12	P53053	380 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	CAF120	P53836	1060 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	ROT1	Q03691	256 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SRO7	Q12038	1033 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		10.85	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MSB2	P32334	1306 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PHO91	P27514	894 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	HXT4	P32467	576 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	STE14	P32584	239 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	WSC4	P38739	605 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	HXT7	P39004	570 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	ALG5	P40350	334 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	HPM1	P40481	377 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MPS3	P47069	682 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SGF73	P53165	657 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	MET31	Q03081	177 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	ACL4	Q03771	387 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YDR124W	Q04608	324 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YFT2	Q06676	274 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YLR413W	Q06689	675 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	YIG1	Q08956	461 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	GPR1	Q12361	961 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	NHA1	Q99271	985 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	FAB1	P34756	2278 aa		10.84	□□□□□ -0.67
RNQ1	YCL028W	CCA1	P21269	546 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	REC107	P21651	314 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MEF1	P25039	761 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	CAB2	P40506	365 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	IAH1	P41734	238 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YFR020W	P43600	232 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PTR3	P43606	678 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SDH1	Q00711	640 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SUL2	Q12325	893 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SAN1	P22470	610 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YCR087C-A	P37263	153 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ZIM17	P42844	174 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	KXD1	P53158	218 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MPS1	P54199	764 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	YDR444W	Q04093	687 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	ECM11	Q04110	302 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	DYN3	Q04949	312 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	BSC2	Q05611	235 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MCH5	Q08777	521 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PFA4	Q12006	378 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	NSL1	Q12143	216 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MDM35	O60200	86 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	PHO81	P17442	1178 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SPS22	P25380	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	CSM1	P25651	190 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	FUN30	P31380	1131 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MUM2	P38236	366 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	SSU1	P41930	458 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	MET12	P46151	657 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RNQ1	YCL028W	NUP85	P46673	744 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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