RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640104.1

SPIN3-235, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,776 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-235ENST00000640104 POTEMA6NI47 508 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 ZBTB5O15062 677 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CHRNA5P30532 468 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CUL5Q93034 780 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 WDR24Q96S15 920 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 FCER1AP12319 257 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 AMPD3Q01432 767 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 STK4Q13043 487 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 SEMA3FQ13275 785 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 GRB10Q13322 594 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 TTI2Q6NXR4 508 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 MYH4Q9Y623 1939 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CCDC51Q96ER9 411 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 THAP9Q9H5L6 903 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-235ENST00000640104 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 CASQ1P31415 396 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 AOC3Q16853 763 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 STYK1Q6J9G0 422 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 HPS3Q969F9 1004 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 PNMA5Q96PV4 448 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.96□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SCN9AQ15858 1988 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SLC1A4P43007 532 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MCM6Q14566 821 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SV2BQ7L1I2 683 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 P2RX5Q93086 422 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MTMR8Q96EF0 704 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 IDI2Q9BXS1 227 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 RAB34Q9BZG1 259 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SIPA1L1O43166 1804 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 A0A0U1RQJ8 604 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 LGALS16A8MUM7 142 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 TRIM14Q14142 442 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MRIQ9BWK5 157 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SLX4Q8IY92 1834 aa14.95□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 CCNE1P24864 410 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ERVK-24P63145 666 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SEPT2Q15019 361 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SLFN13Q68D06 897 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MB21D1Q8N884 522 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 GJA10Q969M2 543 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 STK17AQ9UEE5 414 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 GDF11O95390 407 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 FECHP22830 423 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 KRT9P35527 623 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 BICDL2A1A5D9 508 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 MYMKA6NI61 221 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ICA1Q05084 483 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 KRT79Q5XKE5 535 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 DYMQ7RTS9 669 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 NYAP2Q9P242 653 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 USP17L15C9J2P7 530 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-235ENST00000640104 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms